216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0651 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 524 aa  1010    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  53.62 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  49.58 
 
 		 559 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  47.48 
 
 		 528 aa  353  5e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  28.34 
 
 		 499 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  30.47 
 
 		 499 aa  127  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  27.83 
 
 		 495 aa  126  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  28.19 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  27.27 
 
 		 508 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  30.73 
 
 		 490 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  27.13 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  25.22 
 
 		 662 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  27.22 
 
 		 491 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  26.78 
 
 		 500 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  28.3 
 
 		 577 aa  94  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 		 514 aa  94  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  23.66 
 
 		 690 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 647 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  28.69 
 
 		 537 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.26 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  25.63 
 
 		 486 aa  84  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  22.65 
 
 		 587 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  24.59 
 
 		 522 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.25 
 
 		 449 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  24.73 
 
 		 762 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0872  Outer membrane protein-like  27.04 
 
 		 517 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  23.88 
 
 		 510 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  25.05 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 590 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3997  Outer membrane protein-like protein  25.54 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000837564 
 
 
-
 
NC_003296  RS03082  hypothetical protein  26.32 
 
 		 492 aa  67  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208658  normal  0.984334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  27.04 
 
 		 459 aa  66.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.81 
 
 		 453 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  27.06 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  25.76 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  25.26 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.69 
 
 		 451 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.47 
 
 		 481 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2109  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.99 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  25.48 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  22.95 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  23.18 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0090  hypothetical protein  27.3 
 
 		 731 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.73 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.97 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.07 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 		 449 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.4 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.1 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  25 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  24.67 
 
 		 493 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.67 
 
 		 493 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  29.8 
 
 		 565 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  24.67 
 
 		 493 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  24.67 
 
 		 495 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  24.67 
 
 		 495 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2831  putative outer membrane protein  21.32 
 
 		 483 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000620867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  24.67 
 
 		 493 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  24.67 
 
 		 493 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  24.34 
 
 		 495 aa  55.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  24.67 
 
 		 493 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.38 
 
 		 483 aa  55.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.7 
 
 		 445 aa  55.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  23.63 
 
 		 493 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2180  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.9 
 
 		 874 aa  55.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000461522  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.74 
 
 		 497 aa  54.7  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.57 
 
 		 442 aa  54.3  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  25.49 
 
 		 458 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.64 
 
 		 494 aa  54.3  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  25.68 
 
 		 470 aa  54.3  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1557  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.76 
 
 		 455 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.86 
 
 		 459 aa  54.3  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  26.58 
 
 		 419 aa  53.5  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25 
 
 		 504 aa  53.5  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.53 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  26.4 
 
 		 433 aa  53.5  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  23.58 
 
 		 462 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  22.09 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.99 
 
 		 472 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.46 
 
 		 436 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.66 
 
 		 456 aa  52.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.34 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  24.48 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2905  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.18 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.29 
 
 		 452 aa  52  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.72 
 
 		 518 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  24.19 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.18 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  22.87 
 
 		 432 aa  51.2  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0056  porin (omp) ABC transporter protein  26.76 
 
 		 460 aa  51.6  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.02 
 
 		 487 aa  51.6  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  24.69 
 
 		 482 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.82 
 
 		 463 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.42 
 
 		 455 aa  50.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  24.14 
 
 		 489 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  24.14 
 
 		 489 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  24.14 
 
 		 489 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>