More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1874 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  79.67 
 
 		 253 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  78.46 
 
 		 246 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  74.69 
 
 		 246 aa  345  4e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 275 aa  145  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  35.32 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 215 aa  99.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 213 aa  98.6  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 227 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 234 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 234 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 226 aa  88.6  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 266 aa  87  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  32.57 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  27.51 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  28.87 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21260  transcriptional regulator, tetR family  31.03 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.646658  normal  0.296128 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1198  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  26.41 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  36.61 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0230  DNA-binding transcriptional repressor FabR  29.7 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220471  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0335  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.63 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.04 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0192  DNA-binding transcriptional repressor FabR  29.3 
 
 		 204 aa  62  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0188643  normal  0.031406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0124  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.63 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000427607  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00264  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.29 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0198  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.63 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0179  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.63 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00396424  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3541  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.63 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018845  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0177  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.63 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0234685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0172  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.63 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.291893  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4078  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.63 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00684362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0178  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.63 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155373  normal  0.944765 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0175  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.63 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0116142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4180  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.63 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0026827  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2369  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.4 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4339  DNA-binding transcriptional repressor FabR  32.74 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000022912  hitchhiker  0.00000127177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4711  DNA-binding transcriptional repressor FabR  32.74 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002153  unsaturated fatty acid biosythesis repressor FabR  34.45 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000110455  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0137  DNA-binding transcriptional repressor FabR  32.74 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0129  DNA-binding transcriptional repressor FabR  32.35 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.555645  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03848  DNA-binding transcriptional repressor  31.19 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0143191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4023  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4053  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.19 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  0.0185922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4410  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.19 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0500651  normal  0.0177189 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4197  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.19 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00988726  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03797  hypothetical protein  31.19 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0112282  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4449  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.19 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.563556  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4504  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.19 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5426  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.19 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0614494  normal  0.10498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03580  DNA-binding transcriptional repressor FabR  29.15 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.163329  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0163  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.86 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000509997  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4023  DNA-binding transcriptional repressor FabR  32.14 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23914  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3786  DNA-binding transcriptional repressor FabR  30.15 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 400 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4773  DNA-binding transcriptional repressor FabR  28.28 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00222933  hitchhiker  0.00284138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0139  DNA-binding transcriptional repressor FabR  28.28 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0390891  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4076  DNA-binding transcriptional repressor FabR  28.28 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2889  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.33 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0120  DNA-binding transcriptional repressor FabR  28.28 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102544  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1493  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.55 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.132494  normal  0.0684627 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0189  DNA-binding transcriptional repressor FabR  30 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.368893  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 212 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 212 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 212 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 197 aa  52  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 216 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0195  DNA-binding transcriptional repressor FabR  29.29 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>