More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2672 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
619 aa  1275    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
737 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
2072 aa  296  7e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 
732 aa  295  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 
763 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 
1399 aa  272  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.48 
 
 
1276 aa  271  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 
769 aa  249  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 
608 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
1325 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
1439 aa  239  9e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
844 aa  237  4e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
968 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
727 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
768 aa  230  6e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
771 aa  229  9e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 
873 aa  229  9e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
1121 aa  228  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.4 
 
 
1338 aa  226  8e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
901 aa  224  4.9999999999999996e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
841 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
1032 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
1301 aa  219  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
931 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
639 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 
653 aa  213  7.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
1050 aa  212  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
862 aa  211  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
968 aa  209  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
563 aa  208  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
651 aa  207  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
766 aa  206  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
813 aa  205  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 
569 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
736 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
1425 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
644 aa  199  9e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
765 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
1758 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 
1069 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
1111 aa  198  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 
931 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
589 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
596 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
603 aa  196  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
655 aa  194  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
896 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
1426 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
753 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 
638 aa  192  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 
440 aa  190  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 
472 aa  190  7e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 
657 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
783 aa  188  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
1039 aa  188  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
1225 aa  188  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1413  putative PAS/PAC sensor protein  28.15 
 
 
1251 aa  188  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.629832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
1039 aa  187  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  28.26 
 
 
1265 aa  187  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 
929 aa  186  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 
559 aa  184  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
1078 aa  185  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
431 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
619 aa  184  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
1055 aa  182  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 
813 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0999  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
455 aa  181  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0658985  normal  0.43266 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
935 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
1253 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 
440 aa  180  9e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
789 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 
720 aa  177  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.24 
 
 
600 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 
493 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1158  putative PAS/PAC sensor protein  51.22 
 
 
753 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
593 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 
530 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 
566 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
472 aa  174  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
656 aa  174  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1676  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.12 
 
 
1021 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267843  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
439 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
433 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
781 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
581 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2676  histidine kinase  42.06 
 
 
213 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364042  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
544 aa  172  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  33.54 
 
 
565 aa  171  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 
472 aa  170  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 
347 aa  170  9e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
638 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.53 
 
 
524 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
481 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0656222  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 
603 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
552 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  25.24 
 
 
783 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2642  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
510 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.848189  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
974 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
500 aa  163  9e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>