More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2671 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2671  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 287 aa  591  1e-168  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.63 
 
 		 1121 aa  177  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.78 
 
 		 1039 aa  175  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 596 aa  168  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 737 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  44.32 
 
 		 511 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 		 789 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 500 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 909 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 593 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  40.11 
 
 		 1265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 1111 aa  125  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  40.57 
 
 		 400 aa  125  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  43.12 
 
 		 200 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 660 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 1078 aa  123  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 		 608 aa  123  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 1439 aa  123  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 		 768 aa  123  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 		 896 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 603 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.97 
 
 		 771 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  38.46 
 
 		 637 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 1301 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  36.61 
 
 		 401 aa  116  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 931 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  46.4 
 
 		 196 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 886 aa  116  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 		 656 aa  115  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 862 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 753 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 		 769 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  38.2 
 
 		 458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 1253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 1039 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.76 
 
 		 2072 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 		 550 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.23 
 
 		 653 aa  113  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 544 aa  113  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  37.87 
 
 		 1113 aa  112  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 657 aa  112  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 		 530 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 984 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 766 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 524 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 		 1426 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  41.86 
 
 		 669 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  40.88 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  47.73 
 
 		 559 aa  109  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  34.04 
 
 		 837 aa  109  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 472 aa  109  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 813 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 849 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  38.79 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 627 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  37.82 
 
 		 812 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 980 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  46.4 
 
 		 186 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 1513 aa  106  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 1032 aa  106  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 474 aa  106  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 878 aa  105  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 873 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 783 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3166  putative PAS/PAC sensor protein  40.46 
 
 		 483 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.51 
 
 		 644 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 603 aa  102  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 720 aa  102  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 		 1325 aa  102  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2388  response regulator receiver  41.03 
 
 		 127 aa  99.8  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0389923  normal  0.541574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 		 376 aa  99.8  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  30.73 
 
 		 479 aa  99.8  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  43.41 
 
 		 440 aa  99.8  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 781 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 763 aa  97.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 784 aa  97.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 		 1276 aa  97.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  37.23 
 
 		 477 aa  96.7  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 901 aa  95.9  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 1425 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0264  response regulator receiver domain-containing protein  40.32 
 
 		 178 aa  93.2  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1923  response regulator receiver domain-containing protein  38.81 
 
 		 149 aa  92.4  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  33.5 
 
 		 906 aa  90.5  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 347 aa  89.4  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  33.86 
 
 		 461 aa  89.4  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 619 aa  88.6  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2673  response regulator receiver domain-containing protein  38.58 
 
 		 133 aa  84  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0054  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.38 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 764 aa  81.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 758 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0050  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.97 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 685 aa  79.3  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 446 aa  79.3  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 765 aa  79  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 921 aa  79  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2296  response regulator receiver domain-containing protein  30.12 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621544 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.88 
 
 		 487 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  27.83 
 
 		 632 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 1045 aa  75.1  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>