105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2222 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2222  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
374 aa  772    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  21.74 
 
 
576 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 
792 aa  59.7  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 
265 aa  60.1  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.95 
 
 
1022 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  25 
 
 
1013 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
643 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 
594 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
393 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.99 
 
 
784 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.87 
 
 
730 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.38 
 
 
818 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 
395 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 
4079 aa  54.3  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.18 
 
 
1056 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
565 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 
927 aa  53.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28 
 
 
668 aa  53.5  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.54 
 
 
639 aa  53.1  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 
1276 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  22.74 
 
 
436 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  20.71 
 
 
878 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 
1069 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  25.11 
 
 
560 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.61 
 
 
2240 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2787  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.86 
 
 
333 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 
1049 aa  50.4  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.88 
 
 
988 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 
448 aa  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.43 
 
 
629 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 
632 aa  49.7  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  26.11 
 
 
573 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 
393 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.38 
 
 
1056 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 
1056 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 
291 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.88 
 
 
837 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 
2262 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.05 
 
 
647 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 
465 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  23.24 
 
 
638 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 
243 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
366 aa  47.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  20.96 
 
 
810 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 
357 aa  47  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 
486 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 
591 aa  46.6  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 
605 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0275  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
587 aa  46.2  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2697  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 
268 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000108911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.03 
 
 
1737 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 
597 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  20.87 
 
 
265 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  23.93 
 
 
833 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
563 aa  46.2  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1722  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.26 
 
 
354 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  24.71 
 
 
992 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 
224 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  24.09 
 
 
573 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  21.78 
 
 
267 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 
649 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.52 
 
 
887 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
804 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  23.94 
 
 
936 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4639  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 
955 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.14 
 
 
286 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.88 
 
 
265 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.93 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.2 
 
 
632 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  23.49 
 
 
626 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 
927 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  23.62 
 
 
820 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  21.17 
 
 
564 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  20.99 
 
 
1486 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  23.49 
 
 
614 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  23.49 
 
 
614 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 
614 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 
227 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  19.68 
 
 
361 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.35 
 
 
358 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4615  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.85 
 
 
1402 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
2262 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2402  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  27.74 
 
 
477 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
265 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  23.49 
 
 
626 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 
614 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 
614 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.21 
 
 
363 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.21 
 
 
363 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  23.17 
 
 
135 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1998  uncharacterized protein involved in fimbrial biogenesis  23.78 
 
 
267 aa  43.5  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  25.82 
 
 
837 aa  43.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  25.6 
 
 
929 aa  43.1  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  23.35 
 
 
623 aa  43.1  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  21.67 
 
 
467 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 
828 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
1127 aa  43.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  21.19 
 
 
265 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>