More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5245 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  100 
 
 
585 aa  1175    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  80.42 
 
 
342 aa  556  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  48.7 
 
 
999 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  48.7 
 
 
999 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  48.41 
 
 
999 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  44.31 
 
 
1029 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  36.61 
 
 
1657 aa  194  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.33 
 
 
367 aa  160  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  36.66 
 
 
367 aa  158  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  36.84 
 
 
371 aa  156  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  34.91 
 
 
469 aa  151  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.11 
 
 
396 aa  150  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  33.11 
 
 
388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.91 
 
 
414 aa  144  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  34.84 
 
 
422 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  31.22 
 
 
712 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.82 
 
 
455 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  32.21 
 
 
410 aa  139  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.41 
 
 
729 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.58 
 
 
442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.65 
 
 
450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.98 
 
 
451 aa  134  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  38.3 
 
 
461 aa  133  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  35.16 
 
 
381 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  32.34 
 
 
366 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  35.56 
 
 
408 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.45 
 
 
809 aa  131  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  33.77 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  35.75 
 
 
388 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  36.19 
 
 
363 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  38.74 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.67 
 
 
392 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  33.23 
 
 
385 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 
387 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  37.61 
 
 
366 aa  127  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  36.3 
 
 
407 aa  126  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  30.77 
 
 
1132 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  32.92 
 
 
385 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  30.38 
 
 
382 aa  124  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  31.1 
 
 
376 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  35.9 
 
 
370 aa  123  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  27.15 
 
 
392 aa  124  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  37.56 
 
 
369 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  29.01 
 
 
395 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.47 
 
 
403 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  36.04 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  37.97 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  29.01 
 
 
395 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  34.96 
 
 
377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  31.45 
 
 
482 aa  121  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  31.66 
 
 
385 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.03 
 
 
360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.5 
 
 
427 aa  120  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  29.71 
 
 
428 aa  120  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  30.82 
 
 
357 aa  120  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  29.71 
 
 
428 aa  120  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  34.72 
 
 
748 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  36.79 
 
 
343 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  36.25 
 
 
383 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  33.22 
 
 
676 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  29.03 
 
 
432 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  31.43 
 
 
399 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  31.55 
 
 
419 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  33.63 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.86 
 
 
460 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  32.73 
 
 
398 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  35.63 
 
 
404 aa  118  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  33.53 
 
 
378 aa  118  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  31.36 
 
 
387 aa  118  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  33.08 
 
 
394 aa  118  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  32.24 
 
 
394 aa  117  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  35.08 
 
 
391 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  30.54 
 
 
972 aa  117  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  32.39 
 
 
475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.38 
 
 
1200 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  34.8 
 
 
465 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.28 
 
 
388 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  31.25 
 
 
263 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  31.11 
 
 
369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  28.34 
 
 
381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  29.97 
 
 
374 aa  115  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  29.97 
 
 
374 aa  115  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  36.73 
 
 
382 aa  115  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  28.41 
 
 
373 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  29.83 
 
 
386 aa  114  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  32.9 
 
 
841 aa  114  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  32.89 
 
 
335 aa  114  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  35.45 
 
 
376 aa  114  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  27.67 
 
 
388 aa  113  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  34.51 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  35.27 
 
 
377 aa  113  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
377 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  30 
 
 
391 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  35.07 
 
 
405 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  30.26 
 
 
466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  38.16 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  35.71 
 
 
392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  28.05 
 
 
430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  29.62 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>