More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4572 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  418  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4973  TetR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 201 aa  202  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0231413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1774  TetR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4907  TetR family transcriptional regulator  52.79 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4416  TetR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4503  TetR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.437982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4797  TetR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1513  TetR family transcriptional regulator  49.75 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  0.703699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4804  TetR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4423  TetR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4510  TetR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  33.12 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  36.84 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 190 aa  51.6  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03459  hypothetical protein  24.23 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 184 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002553  quorum-sensing regulator of virulence HapR  24.86 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0652  Transcriptional regulator protein  46.81 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  51.11 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2000  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 191 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 189 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>