158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2413 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2413  methylation  100 
 
 
157 aa  317  6e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  61.18 
 
 
161 aa  194  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  60.13 
 
 
158 aa  194  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  64.29 
 
 
159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  60 
 
 
172 aa  187  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  62.5 
 
 
170 aa  186  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  60.13 
 
 
168 aa  186  8e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  54.14 
 
 
172 aa  168  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4705  putative secretion type II protein  57.14 
 
 
176 aa  168  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420147  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  53.9 
 
 
157 aa  158  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  54.84 
 
 
159 aa  152  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  50.97 
 
 
160 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1335  methylation  51.97 
 
 
161 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0885873  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  46.45 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2460  secretion type II protein  51.61 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839329  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2294  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  50.97 
 
 
159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.797755  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3477  hypothetical protein  50.97 
 
 
159 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103302  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2469  G protein signal peptide-like secretion type II protein  51.61 
 
 
157 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354384  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1439  general secretion pathway GspG related transmembrane protein  48.39 
 
 
160 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0119159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  44.94 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  46.88 
 
 
164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  45.22 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  42.67 
 
 
140 aa  114  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  42.68 
 
 
177 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2998  hypothetical protein  47.2 
 
 
164 aa  110  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000440497 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1285  hypothetical protein  47.2 
 
 
164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2414  general secretion pathway protein G  45.86 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  45.28 
 
 
161 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1461  hypothetical protein  45.22 
 
 
162 aa  100  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  38.46 
 
 
135 aa  90.1  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  37.74 
 
 
137 aa  84  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  37.82 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  36.25 
 
 
153 aa  79  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  32.12 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  30.38 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  32.37 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  32.48 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  33.12 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  34.21 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  32.48 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  29.94 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  31.21 
 
 
128 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  31.21 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  30.57 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  30.92 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  28.39 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  30.57 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  30.72 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  28.57 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  31.61 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  34.51 
 
 
124 aa  54.3  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  29.03 
 
 
133 aa  54.3  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  30.2 
 
 
121 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  34.12 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  30.67 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  32.94 
 
 
142 aa  51.2  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  33.79 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  30.07 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  31.37 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  31.62 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02980  putative transmembrane protein  28.47 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174988  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  29.75 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  29.75 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  29.75 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  32.14 
 
 
146 aa  47.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  29.75 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  29.75 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  31.86 
 
 
145 aa  47.4  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  32.05 
 
 
149 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  30.43 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  27.92 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  27.92 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  44.64 
 
 
165 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  32.05 
 
 
149 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  29.11 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  33.04 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  30.95 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0542  hypothetical protein  33.6 
 
 
236 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  32.43 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  37.5 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  33.8 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  31.51 
 
 
184 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  40.35 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  33.04 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  28.89 
 
 
145 aa  44.7  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  30.28 
 
 
144 aa  44.7  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  32.05 
 
 
313 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  32.14 
 
 
144 aa  44.7  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  33.63 
 
 
144 aa  44.3  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  28.97 
 
 
143 aa  43.9  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  35.38 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  36 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  30.13 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  27.46 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  35.71 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  28.48 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2669  hypothetical protein  35.06 
 
 
567 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70163  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  34.26 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0347967 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>