207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2193 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  47.69 
 
 
750 aa  675    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  46.86 
 
 
767 aa  642    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  100 
 
 
780 aa  1615    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  47.18 
 
 
793 aa  687    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  44.66 
 
 
772 aa  630  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  45.6 
 
 
766 aa  615  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  40.99 
 
 
769 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  41.14 
 
 
716 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  41.52 
 
 
721 aa  496  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  40.86 
 
 
729 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  40 
 
 
766 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0965  TonB-dependent receptor  38.16 
 
 
773 aa  490  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.195804  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  39.53 
 
 
758 aa  488  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  39.73 
 
 
741 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  37.87 
 
 
775 aa  465  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  37.97 
 
 
744 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  36.9 
 
 
708 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  36.9 
 
 
713 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  35.4 
 
 
713 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  36.62 
 
 
713 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  36.76 
 
 
713 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  34.47 
 
 
708 aa  389  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  36.38 
 
 
713 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 
713 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  35.84 
 
 
713 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
717 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 
714 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  32.82 
 
 
701 aa  336  9e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 
749 aa  174  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 
685 aa  173  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 
718 aa  160  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 
705 aa  144  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 
705 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  23.29 
 
 
698 aa  115  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  23.29 
 
 
725 aa  115  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  22.25 
 
 
710 aa  105  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  22.25 
 
 
710 aa  105  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  22.25 
 
 
710 aa  105  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  22.02 
 
 
687 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  21.88 
 
 
709 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 
673 aa  102  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  22.24 
 
 
710 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  22.99 
 
 
719 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  21.19 
 
 
749 aa  97.4  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  21.19 
 
 
749 aa  97.4  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 
698 aa  97.4  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  22.06 
 
 
688 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  22.59 
 
 
723 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  21.05 
 
 
745 aa  95.9  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  21.54 
 
 
713 aa  95.1  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  20.69 
 
 
687 aa  94.7  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  22.56 
 
 
688 aa  94.4  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 
697 aa  94  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  21.5 
 
 
753 aa  93.6  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  22.06 
 
 
688 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  20.9 
 
 
745 aa  92  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  20.9 
 
 
745 aa  92  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  20.9 
 
 
745 aa  92  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  22.56 
 
 
688 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  23.02 
 
 
710 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 
681 aa  90.5  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 
768 aa  89  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  22.29 
 
 
676 aa  86.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  21.55 
 
 
691 aa  86.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  22.14 
 
 
676 aa  84  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 
699 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  19.61 
 
 
760 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  21.81 
 
 
695 aa  79.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 
668 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  25.4 
 
 
684 aa  78.6  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 
702 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  21.7 
 
 
724 aa  76.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  21.22 
 
 
726 aa  76.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  21.57 
 
 
667 aa  73.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 
668 aa  72  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 
702 aa  70.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  25.23 
 
 
681 aa  69.3  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  24.66 
 
 
681 aa  68.2  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  24.66 
 
 
686 aa  67  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  22.97 
 
 
668 aa  64.7  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  22.87 
 
 
669 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.99 
 
 
728 aa  63.9  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.95 
 
 
862 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  22.26 
 
 
668 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  21.66 
 
 
702 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  23.64 
 
 
699 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 
672 aa  59.7  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  21.61 
 
 
683 aa  59.7  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 
684 aa  58.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 
685 aa  58.5  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 
661 aa  57.8  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 
694 aa  57.4  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 
702 aa  57.4  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  31.41 
 
 
759 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  25.4 
 
 
661 aa  55.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02495  hypothetical protein  29.03 
 
 
777 aa  55.5  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  31.41 
 
 
862 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  26.79 
 
 
662 aa  54.3  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  27.56 
 
 
663 aa  53.9  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  35.04 
 
 
861 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>