More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1500 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  100 
 
 
203 aa  410  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  66.16 
 
 
200 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  63.86 
 
 
205 aa  257  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  63.5 
 
 
203 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  60.4 
 
 
205 aa  249  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  60.3 
 
 
204 aa  246  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  59.41 
 
 
205 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  56.28 
 
 
204 aa  239  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  59.7 
 
 
206 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  59.2 
 
 
206 aa  236  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  59.69 
 
 
206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  59.69 
 
 
206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  59.69 
 
 
206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  59.18 
 
 
206 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  59.69 
 
 
206 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  56.72 
 
 
206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  57.14 
 
 
205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  56.22 
 
 
206 aa  231  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  58.16 
 
 
206 aa  230  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  58.16 
 
 
206 aa  230  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  57.71 
 
 
206 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  57.71 
 
 
206 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  57.71 
 
 
206 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  57.71 
 
 
206 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  57.71 
 
 
206 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  57.21 
 
 
206 aa  228  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  57.21 
 
 
206 aa  228  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  53.96 
 
 
215 aa  214  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  53.81 
 
 
210 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  55 
 
 
217 aa  211  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  57.89 
 
 
214 aa  211  9e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  55.79 
 
 
211 aa  210  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  54.4 
 
 
207 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  54.82 
 
 
210 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  54.5 
 
 
217 aa  208  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  59.5 
 
 
233 aa  208  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  51.96 
 
 
210 aa  207  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  52.04 
 
 
218 aa  206  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  55.67 
 
 
210 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  52.79 
 
 
210 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  51.2 
 
 
210 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  55.1 
 
 
211 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  55.15 
 
 
210 aa  205  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  52.33 
 
 
208 aa  203  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  53.89 
 
 
217 aa  200  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  55.1 
 
 
226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  50.76 
 
 
210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  53.77 
 
 
212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  50.24 
 
 
221 aa  195  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  46.77 
 
 
223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  46.77 
 
 
223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  51.24 
 
 
215 aa  194  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  47 
 
 
219 aa  194  9e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  45.87 
 
 
225 aa  191  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  48.98 
 
 
214 aa  190  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  52.94 
 
 
228 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  47.69 
 
 
208 aa  187  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  47.98 
 
 
206 aa  186  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  54.27 
 
 
220 aa  181  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  43.15 
 
 
212 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  48.77 
 
 
224 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  50.73 
 
 
226 aa  177  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  42.92 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  43.81 
 
 
217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  50.5 
 
 
219 aa  171  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  39.22 
 
 
216 aa  166  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  48.48 
 
 
215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  49.46 
 
 
688 aa  162  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  44.06 
 
 
214 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  45.5 
 
 
207 aa  158  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  44.56 
 
 
224 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  41.95 
 
 
213 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  43.43 
 
 
232 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  44.1 
 
 
205 aa  155  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  40.89 
 
 
671 aa  155  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  45.5 
 
 
230 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  40.78 
 
 
225 aa  155  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  43.48 
 
 
234 aa  154  6e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  43.3 
 
 
901 aa  154  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  41.87 
 
 
210 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  41.58 
 
 
219 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1588  dTMP kinase  43.3 
 
 
214 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0735324 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1913  thymidylate kinase  43.3 
 
 
214 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.325881  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  38.07 
 
 
197 aa  153  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  41.58 
 
 
222 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  40.1 
 
 
206 aa  153  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  45.61 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  38.81 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  44.06 
 
 
221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  41.71 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  41.71 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  41.71 
 
 
212 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  42.5 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  42.86 
 
 
208 aa  151  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  42.93 
 
 
226 aa  151  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  42.23 
 
 
230 aa  151  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  44.75 
 
 
210 aa  150  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  39.32 
 
 
225 aa  150  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  38.58 
 
 
199 aa  150  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  43.3 
 
 
215 aa  149  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>