More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1218 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  77.83 
 
 
1054 aa  1692    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0947  hypothetical protein  47.8 
 
 
1051 aa  944    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0339095  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1218  DEAD/DEAH box helicase-like protein  100 
 
 
1053 aa  2129    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.853055  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  77.83 
 
 
1054 aa  1692    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1187  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  80.4 
 
 
1056 aa  1664    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.01 
 
 
1085 aa  613  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  25.6 
 
 
760 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.6 
 
 
739 aa  125  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0662  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.74 
 
 
1032 aa  124  9e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  28.51 
 
 
693 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.11 
 
 
751 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  25.24 
 
 
726 aa  115  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.53 
 
 
694 aa  114  9e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  27.16 
 
 
729 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.35 
 
 
780 aa  114  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.53 
 
 
709 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  28.34 
 
 
824 aa  112  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.63 
 
 
747 aa  110  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.68 
 
 
746 aa  110  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.95 
 
 
791 aa  110  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.78 
 
 
1197 aa  108  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.56 
 
 
715 aa  107  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.83 
 
 
1064 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0686231  normal  0.184545 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  26.92 
 
 
712 aa  107  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  27.69 
 
 
723 aa  106  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  27.74 
 
 
1767 aa  105  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.47 
 
 
747 aa  106  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.36 
 
 
803 aa  105  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.42 
 
 
1032 aa  105  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  27.48 
 
 
799 aa  105  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.15 
 
 
800 aa  105  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.41 
 
 
807 aa  104  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23 
 
 
707 aa  104  9e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.94 
 
 
707 aa  103  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.47 
 
 
785 aa  103  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  27.01 
 
 
1173 aa  103  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.11 
 
 
707 aa  103  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4837  putative dead/deah box helicase domain protein  25.49 
 
 
849 aa  102  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.907663 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3383  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.52 
 
 
868 aa  101  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865687  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  25.85 
 
 
882 aa  100  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  28.29 
 
 
1173 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  27.11 
 
 
1165 aa  100  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  24.61 
 
 
1068 aa  100  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.77 
 
 
662 aa  99.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.82 
 
 
799 aa  100  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  27.91 
 
 
1465 aa  99.8  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.62 
 
 
729 aa  99.4  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.73 
 
 
706 aa  99.4  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  24.74 
 
 
998 aa  97.8  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  26.71 
 
 
2189 aa  97.4  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  26.44 
 
 
1073 aa  97.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  27.94 
 
 
1068 aa  96.3  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  26.99 
 
 
2111 aa  96.3  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  25.83 
 
 
933 aa  95.9  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  26.73 
 
 
1060 aa  94  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.55 
 
 
756 aa  94  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1150  DEAD/DEAH box helicase-like  26.67 
 
 
858 aa  93.6  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.794218  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  25.45 
 
 
727 aa  91.7  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.44 
 
 
708 aa  91.3  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.28 
 
 
1166 aa  89.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.11 
 
 
952 aa  89.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  23.95 
 
 
2157 aa  89  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2283  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.21 
 
 
1220 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  27.45 
 
 
889 aa  88.6  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  22.67 
 
 
874 aa  87.8  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05514  DEAD/DEAH box DNA helicase (Mer3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13080)  23.92 
 
 
1385 aa  86.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451829  normal  0.647308 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  31.44 
 
 
825 aa  85.5  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.06 
 
 
843 aa  85.1  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3112  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  23.02 
 
 
828 aa  84  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.471561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  26.38 
 
 
905 aa  83.2  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  27.86 
 
 
808 aa  84  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  24.24 
 
 
872 aa  83.2  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  26.22 
 
 
2015 aa  82.8  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  25.76 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  22.38 
 
 
1770 aa  82  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.55 
 
 
845 aa  82  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.18 
 
 
868 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19790  superfamily II helicase  34.75 
 
 
852 aa  80.1  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.21 
 
 
861 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3891  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  23.68 
 
 
1216 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  26.54 
 
 
893 aa  79.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.21 
 
 
861 aa  79  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  24 
 
 
861 aa  79  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5115  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  23.28 
 
 
1205 aa  79  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  24.15 
 
 
927 aa  78.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.84 
 
 
988 aa  79  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.61 
 
 
700 aa  79  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.46 
 
 
817 aa  78.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  26.2 
 
 
936 aa  78.6  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  24.32 
 
 
1589 aa  78.2  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.68 
 
 
856 aa  78.2  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00467654  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  23.9 
 
 
927 aa  78.2  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.88 
 
 
1265 aa  77.4  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.54 
 
 
894 aa  76.3  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  25.59 
 
 
904 aa  76.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  24.75 
 
 
890 aa  75.5  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  24.76 
 
 
909 aa  75.1  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.05 
 
 
710 aa  75.1  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  23.64 
 
 
919 aa  75.1  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  33.04 
 
 
870 aa  74.3  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>