81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2103 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 249 aa  497  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  73.45 
 
 		 287 aa  176  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  74.34 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  74.11 
 
 		 287 aa  175  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  58.97 
 
 		 368 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  67.24 
 
 		 164 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  57.02 
 
 		 333 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  43.92 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  58.62 
 
 		 150 aa  141  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  58.62 
 
 		 150 aa  141  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  60.34 
 
 		 150 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  41.8 
 
 		 305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1037  lytic transglycosylase, catalytic  56.03 
 
 		 156 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  58.26 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  50.86 
 
 		 165 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 428 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  56.88 
 
 		 326 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  59.26 
 
 		 342 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  48.62 
 
 		 277 aa  98.6  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  58.49 
 
 		 309 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  59.81 
 
 		 375 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  51.28 
 
 		 158 aa  92  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  52.14 
 
 		 158 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  45.69 
 
 		 175 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  55.66 
 
 		 298 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  55.66 
 
 		 297 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  48.45 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  45.92 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  44.25 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  36.16 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  54.79 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.36 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.36 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  39 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  38.78 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  35.79 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  31.75 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  35.79 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 325 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  34.74 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  33.68 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  35.96 
 
 		 188 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  34.02 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  34.02 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  32.99 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  34.02 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  32.99 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  39.19 
 
 		 197 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  30.77 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  36.14 
 
 		 283 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  33 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  36.49 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  32.93 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  34.18 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  30.48 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  31.96 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  36.49 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  30.69 
 
 		 287 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  34.44 
 
 		 645 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  32.69 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  34.44 
 
 		 645 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  34.44 
 
 		 645 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  34.44 
 
 		 645 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  32.69 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  34.44 
 
 		 645 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  34.44 
 
 		 645 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  34.44 
 
 		 645 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  34.44 
 
 		 645 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  34.44 
 
 		 645 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  38.36 
 
 		 709 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  31.9 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  38.36 
 
 		 709 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  32.73 
 
 		 362 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.65 
 
 		 226 aa  42  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 237 aa  42  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  31.9 
 
 		 204 aa  42  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  29.59 
 
 		 217 aa  42  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>