More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0461 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  54.71 
 
 
591 aa  692    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  67.97 
 
 
591 aa  850    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  62.03 
 
 
589 aa  761    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  65.82 
 
 
604 aa  800    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  68.58 
 
 
593 aa  845    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  55.37 
 
 
591 aa  680    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
593 aa  1197    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  54.75 
 
 
602 aa  669    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  51.11 
 
 
578 aa  603  1.0000000000000001e-171  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  49.75 
 
 
599 aa  601  1e-170  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  49.07 
 
 
607 aa  586  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  48.48 
 
 
597 aa  587  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  50.59 
 
 
604 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  49.67 
 
 
602 aa  552  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  45.5 
 
 
598 aa  532  1e-150  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  44.91 
 
 
598 aa  529  1e-149  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  45.24 
 
 
598 aa  524  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  45.58 
 
 
598 aa  524  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  44.91 
 
 
598 aa  509  1e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  45.53 
 
 
588 aa  491  1e-137  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  46.13 
 
 
592 aa  488  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  45.1 
 
 
589 aa  484  1e-135  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  41.72 
 
 
597 aa  476  1e-133  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  41.64 
 
 
601 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  42.55 
 
 
600 aa  467  9.999999999999999e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  43.46 
 
 
592 aa  468  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  43.46 
 
 
593 aa  465  1e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  43 
 
 
594 aa  459  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  38.11 
 
 
623 aa  369  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  36.11 
 
 
1228 aa  362  1e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  37.99 
 
 
1072 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  35.25 
 
 
997 aa  337  2.9999999999999997e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  36.29 
 
 
599 aa  329  1.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  29.46 
 
 
692 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  29.98 
 
 
693 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  30.89 
 
 
854 aa  173  6.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  30.4 
 
 
992 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  30.4 
 
 
992 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  29.8 
 
 
690 aa  172  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  30.73 
 
 
903 aa  170  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  30 
 
 
679 aa  166  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  30 
 
 
571 aa  166  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  30 
 
 
679 aa  166  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  29.23 
 
 
686 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  28.86 
 
 
688 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  29.23 
 
 
686 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  29.23 
 
 
686 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  30.63 
 
 
658 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  29.23 
 
 
686 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  29.04 
 
 
688 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  29.04 
 
 
686 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  29.04 
 
 
686 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  29.23 
 
 
686 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  29.01 
 
 
1042 aa  165  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  30.41 
 
 
1183 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  28.9 
 
 
1030 aa  164  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  29.23 
 
 
689 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  29.51 
 
 
882 aa  164  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  29.83 
 
 
882 aa  164  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  29.34 
 
 
1124 aa  164  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  31.39 
 
 
720 aa  163  7e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  30.41 
 
 
1183 aa  163  7e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  32.96 
 
 
903 aa  163  7e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  29.5 
 
 
887 aa  162  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  28.98 
 
 
1059 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  28.6 
 
 
601 aa  161  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  31.14 
 
 
1005 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  30.16 
 
 
924 aa  160  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  29.23 
 
 
951 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  29.23 
 
 
946 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  28.49 
 
 
732 aa  160  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0326  translation initiation factor IF-2  29.02 
 
 
614 aa  159  1e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1102  translation initiation factor IF-2  29.23 
 
 
950 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.397412  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  29.29 
 
 
705 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  29.29 
 
 
705 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  29.21 
 
 
1113 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  27.65 
 
 
1161 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  28.29 
 
 
739 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  28.67 
 
 
871 aa  159  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  33.41 
 
 
885 aa  159  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  28.8 
 
 
1128 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  28.09 
 
 
970 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  29.54 
 
 
1176 aa  158  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  29.37 
 
 
985 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  32.67 
 
 
928 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  28.32 
 
 
868 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  30.58 
 
 
905 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3221  translation initiation factor IF-2  30.6 
 
 
815 aa  157  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.109257 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  28.2 
 
 
880 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  31.03 
 
 
822 aa  157  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  28.55 
 
 
1104 aa  157  7e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  29.96 
 
 
921 aa  157  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1473  translation initiation factor IF-2  29.29 
 
 
579 aa  156  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147864  unclonable  0.00000476955 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2814  translation initiation factor IF-2  28.47 
 
 
845 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.572575  hitchhiker  0.00404831 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16851  translation initiation factor IF-2  28.55 
 
 
1114 aa  156  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  30.59 
 
 
896 aa  155  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  30.28 
 
 
914 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  27.52 
 
 
692 aa  154  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  28.14 
 
 
656 aa  154  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  30.2 
 
 
927 aa  154  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>