More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1986 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1986  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 300 aa  600  1e-170  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000216285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0852  preprotein translocase subunit SecF  63.21 
 
 		 302 aa  340  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0896  preprotein translocase subunit SecF  47.6 
 
 		 296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.510447  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3177  preprotein translocase subunit SecF  48.42 
 
 		 292 aa  262  6e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1796  preprotein translocase subunit SecF  46.26 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.195427  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1022  preprotein translocase subunit SecF  47.39 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1655  preprotein translocase subunit SecF  49.8 
 
 		 284 aa  238  9e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.198894  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0279  preprotein translocase subunit SecF  43.96 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1321  preprotein translocase subunit SecF  43.49 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1963  preprotein translocase subunit SecF  43.21 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.216648  normal  0.175642 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2708  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  42.62 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0745  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  43.41 
 
 		 294 aa  202  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2688  preprotein translocase subunit SecF  39.31 
 
 		 287 aa  172  9e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0772  preprotein translocase subunit SecF  43.31 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0051  preprotein translocase subunit SecF  54.34 
 
 		 281 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1146  preprotein translocase subunit SecF  54.34 
 
 		 281 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1016  preprotein translocase subunit SecF  39.1 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.161719  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0837  preprotein translocase subunit SecF  52.2 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  27.71 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  24.9 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  23.68 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  28.12 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  23.51 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  23.51 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0235  preprotein translocase subunit SecF  22.5 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.460175  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  27.95 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  23.51 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  25.09 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0066  protein-export membrane protein SecF  26.96 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  28.38 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  27.93 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  27.93 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  27.93 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  27.65 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.69 
 
 		 762 aa  66.2  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  27.65 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  27.65 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  27.65 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  24.48 
 
 		 761 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  26.82 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  23.63 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  27.27 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  26.7 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  27.38 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  26.7 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  27.38 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  26.82 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  26.82 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  25 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  23.11 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  26.98 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  27.46 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  24.77 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  25.79 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  24.77 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  26.27 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  27.98 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  25.45 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  26.36 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  24.77 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  24.77 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  24.77 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  25.13 
 
 		 759 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  25.42 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  26.73 
 
 		 740 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  21.79 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  29.63 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  27.64 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  27.78 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  24.89 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  25.11 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  26.5 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  25.11 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  26.27 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  23.18 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.13 
 
 		 759 aa  59.7  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  25.32 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.13 
 
 		 759 aa  59.7  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  23.18 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  25.11 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  26 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  25.3 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  25.82 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  22.94 
 
 		 735 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1278  preprotein translocase subunit SecF  25.95 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000278006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  23.83 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.12 
 
 		 750 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  25.23 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.32 
 
 		 763 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2716  preprotein translocase subunit SecF  25.85 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.36 
 
 		 785 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  23.95 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  25.23 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  25.23 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0194  preprotein translocase subunit SecF  22.98 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  23.53 
 
 		 849 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  26.04 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0537  protein-export membrane protein SecF  22.74 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416815  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.36 
 
 		 785 aa  57.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4643  preprotein translocase subunit SecF  23.83 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>