More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1875 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  100 
 
 		 237 aa  493  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  47.78 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  49.02 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  46.53 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  47.21 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  44.5 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  44.76 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  45.1 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  44.44 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  42.03 
 
 		 220 aa  174  9e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  43.9 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  44.44 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  43.13 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  42.11 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  44.33 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  41.95 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  44.66 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  42.93 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  41.23 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  39.51 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  41.26 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  41.15 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  40.67 
 
 		 221 aa  162  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  40.38 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  41.43 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  42.4 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  44.17 
 
 		 250 aa  158  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  43.9 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  41.83 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  40.49 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  41.06 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  42.06 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  39.13 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  37.95 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  42.06 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  38.39 
 
 		 232 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  39.64 
 
 		 223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  40.2 
 
 		 216 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.55 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  39.51 
 
 		 226 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  33.18 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  37.84 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  41.23 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  35.27 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  38.35 
 
 		 223 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  38.35 
 
 		 223 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  34.01 
 
 		 219 aa  128  9.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  38.69 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  33.67 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  35.29 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  29.73 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  35 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  30.14 
 
 		 216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  31.31 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  31.31 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  32.02 
 
 		 296 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.56 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  35 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  32.05 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  32.43 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  33.16 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.86 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  34.41 
 
 		 228 aa  98.6  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  34.78 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  34.2 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  33.33 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  32.64 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  35.26 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.94 
 
 		 222 aa  91.7  9e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  29.52 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  32.8 
 
 		 228 aa  89.4  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  30.89 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  30.53 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  32.22 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  29.02 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.61 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  30 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  30.27 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  30.27 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.73 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.59 
 
 		 218 aa  72  0.000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.21 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.04 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  26.11 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.47 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  28.3 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  27.95 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.17 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  25.7 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  28.09 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  24.06 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  27.17 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  27.72 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  23.41 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  27.17 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  27.72 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  25 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  26.63 
 
 		 215 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  26.63 
 
 		 215 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  26.63 
 
 		 215 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>