More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0486 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
424 aa  874    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  60.43 
 
 
419 aa  542  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  60.19 
 
 
428 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  54.52 
 
 
425 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  50.84 
 
 
427 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  46.94 
 
 
425 aa  395  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  44.44 
 
 
426 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  43.77 
 
 
419 aa  353  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  43.99 
 
 
459 aa  350  2e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  43.68 
 
 
430 aa  348  1e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  42.3 
 
 
493 aa  345  7e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  43.48 
 
 
451 aa  333  4e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  41.37 
 
 
468 aa  333  5e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  41.47 
 
 
477 aa  330  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  34.57 
 
 
348 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  39.52 
 
 
363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  37.09 
 
 
394 aa  138  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  36.74 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  36.87 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  38.65 
 
 
436 aa  133  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  36.44 
 
 
703 aa  133  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  37.5 
 
 
426 aa  131  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  32.77 
 
 
326 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.67 
 
 
739 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  38.02 
 
 
371 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  39.29 
 
 
320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.68 
 
 
781 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  35.27 
 
 
829 aa  129  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.82 
 
 
800 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.71 
 
 
732 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  35.24 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60303  predicted protein  32.64 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  32.8 
 
 
308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.29 
 
 
735 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  38.07 
 
 
332 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  38.07 
 
 
332 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  40.34 
 
 
322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  35.56 
 
 
814 aa  127  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.36 
 
 
781 aa  127  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  40.29 
 
 
370 aa  126  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.45 
 
 
784 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.94 
 
 
601 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  37.71 
 
 
322 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.02 
 
 
723 aa  125  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  31.8 
 
 
328 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  31.87 
 
 
327 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  37.69 
 
 
431 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  36.24 
 
 
366 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  32.47 
 
 
369 aa  125  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16182  predicted protein  40.61 
 
 
514 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0647858  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.9 
 
 
756 aa  125  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1798  ATP-dependent M41 family peptidase  35.27 
 
 
1284 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.49 
 
 
601 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03061  vacuolar sorting ATPase Vps4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09360)  34.87 
 
 
434 aa  124  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548011  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.47 
 
 
759 aa  124  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38040  predicted protein  34.95 
 
 
437 aa  124  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.990763  hitchhiker  0.00560331 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  34.06 
 
 
407 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0583  vesicle-fusing ATPase  34.53 
 
 
741 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.26 
 
 
760 aa  123  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  36.97 
 
 
764 aa  123  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.63 
 
 
768 aa  123  7e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  30.08 
 
 
326 aa  123  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.98 
 
 
769 aa  122  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.88 
 
 
740 aa  122  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  37.44 
 
 
404 aa  122  8e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  31.08 
 
 
328 aa  122  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.78 
 
 
731 aa  122  9e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  36.49 
 
 
459 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  31.8 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  30.4 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  37.2 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  33.62 
 
 
407 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  29.96 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  29.69 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.68 
 
 
763 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.78 
 
 
731 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.45 
 
 
510 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.3 
 
 
736 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0592  vesicle-fusing ATPase  34.53 
 
 
741 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524368  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  37.27 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  32.77 
 
 
804 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0605  vesicle-fusing ATPase  34.53 
 
 
741 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  35.51 
 
 
784 aa  121  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1787  AAA ATPase family protein  33.49 
 
 
372 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  35.41 
 
 
379 aa  120  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  33.19 
 
 
407 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10440  ATPase  32.22 
 
 
728 aa  121  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.11 
 
 
662 aa  120  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  47.18 
 
 
360 aa  121  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.9 
 
 
773 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.5 
 
 
737 aa  120  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.3 
 
 
743 aa  121  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.48 
 
 
738 aa  120  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.65 
 
 
659 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  30.08 
 
 
328 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.75 
 
 
754 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.45 
 
 
731 aa  120  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0489  putative cell division protease FtsH-like protein  36.53 
 
 
643 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.78 
 
 
727 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  34.8 
 
 
619 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.208154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>