More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2605 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  100 
 
 		 420 aa  869    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  47.19 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  38.03 
 
 		 433 aa  316  5e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3800  alpha amylase catalytic region  34.66 
 
 		 435 aa  296  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.345712  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  44.44 
 
 		 1122 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  39.77 
 
 		 1122 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  43.3 
 
 		 1126 aa  285  9e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  38.76 
 
 		 1124 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  38.76 
 
 		 1124 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  40.43 
 
 		 1124 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0916  alpha amylase catalytic region  36.46 
 
 		 476 aa  248  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  28.31 
 
 		 1151 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  27.51 
 
 		 1146 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  27.94 
 
 		 1144 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  30.33 
 
 		 1136 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  29.43 
 
 		 1133 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  27.84 
 
 		 1130 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  28.62 
 
 		 1130 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  28.62 
 
 		 1130 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  27.22 
 
 		 1131 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  27.43 
 
 		 1082 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3939  alpha amylase catalytic region  28.22 
 
 		 1196 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4052  alpha amylase catalytic region  28.22 
 
 		 1196 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  26.78 
 
 		 1130 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  26.19 
 
 		 1136 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05182  putative alpha-amylase-related protein  30.33 
 
 		 1201 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00237217  normal  0.176867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.47 
 
 		 1433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  26.92 
 
 		 1115 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  26.1 
 
 		 1115 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0314  alpha amylase, catalytic region  27.01 
 
 		 646 aa  110  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  25.07 
 
 		 426 aa  110  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  26.1 
 
 		 1115 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  26.58 
 
 		 1115 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  28.76 
 
 		 1074 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0331  alpha amylase catalytic region  26.42 
 
 		 652 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  24.38 
 
 		 426 aa  102  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  26.46 
 
 		 1148 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  26.71 
 
 		 422 aa  98.2  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  27.33 
 
 		 1075 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3846  alpha amylase, catalytic region  26.02 
 
 		 695 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0237577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3860  alpha amylase, catalytic region  26.02 
 
 		 695 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3934  alpha amylase, catalytic region  26.02 
 
 		 695 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.538651 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  25.71 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3678  alpha amylase, catalytic region  26.76 
 
 		 672 aa  93.6  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.763851 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2448  hypothetical protein  25.07 
 
 		 516 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1297  alpha amylase catalytic region  27.39 
 
 		 667 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.774826  normal  0.698008 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  33.13 
 
 		 434 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2593  hypothetical protein  25.07 
 
 		 516 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1337  alpha amylase catalytic region  25.11 
 
 		 678 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1279  alpha amylase catalytic region  25.72 
 
 		 666 aa  91.3  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0559691  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1956  alpha amylase catalytic region  25.12 
 
 		 666 aa  90.5  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  34.76 
 
 		 463 aa  90.5  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0679  alpha amylase, catalytic region  24.81 
 
 		 653 aa  90.1  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  24.46 
 
 		 651 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  29.63 
 
 		 1022 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3583  alpha amylase catalytic region  26.06 
 
 		 684 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  23.24 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  25.15 
 
 		 459 aa  86.3  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3482  alpha amylase, catalytic region  24.04 
 
 		 651 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6072  alpha amylase catalytic region  24.88 
 
 		 659 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2344  alpha amylase, catalytic region  24.57 
 
 		 696 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969175  normal  0.43625 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  24.36 
 
 		 816 aa  85.5  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0585  alpha amylase domain-containing protein  25.89 
 
 		 655 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4301  alpha amylase, catalytic region  24.88 
 
 		 696 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1884  alpha amylase, catalytic region  23.81 
 
 		 684 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  25.68 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0249  alpha amylase catalytic region  24.21 
 
 		 656 aa  82.8  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.852341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2858  alpha amylase catalytic region  26.59 
 
 		 681 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4100  alpha amylase catalytic region  24.29 
 
 		 687 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1979  alpha amylase catalytic region  24.88 
 
 		 684 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379903  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1809  alpha amylase, catalytic region  25.62 
 
 		 670 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341723  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0153  alpha amylase catalytic region  24.94 
 
 		 652 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8140  alpha amylase catalytic region  24.69 
 
 		 728 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  29.63 
 
 		 688 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1052  alpha amylase catalytic region  30.2 
 
 		 672 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4097  alpha amylase catalytic sub domain protein  24.88 
 
 		 672 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0571346  normal  0.0314797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10340  glycosidase  25.22 
 
 		 663 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3071  alpha amylase catalytic region  25.5 
 
 		 674 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224313  normal  0.685148 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  29.87 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  24.59 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3176  alpha amylase catalytic region  24.84 
 
 		 682 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000122162  hitchhiker  0.0000126185 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  23.79 
 
 		 708 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0034  alpha amylase catalytic region  25.06 
 
 		 663 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  23.1 
 
 		 734 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  23.24 
 
 		 1037 aa  76.6  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09540  glycosidase  26.1 
 
 		 715 aa  76.3  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0200177  normal  0.351025 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1105  alpha amylase catalytic region  24.75 
 
 		 705 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  23.1 
 
 		 715 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2295  alpha amylase, catalytic region  27.69 
 
 		 660 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0369553  hitchhiker  0.000002386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1466  alpha amylase, catalytic region  24.09 
 
 		 657 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  24.02 
 
 		 672 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11359  glucanase glgE  24.08 
 
 		 701 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.759121 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  24.23 
 
 		 589 aa  73.6  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  23.77 
 
 		 672 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03667  alpha-amylase  26.75 
 
 		 1038 aa  72.8  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533907  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2534  Alpha amylase, catalytic region  25.93 
 
 		 664 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2783  alpha amylase catalytic region  24.93 
 
 		 670 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  27.31 
 
 		 671 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  23.06 
 
 		 724 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0135  alpha amylase catalytic region  23.38 
 
 		 660 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>