173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6385 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  80.44 
 
 		 1530 aa  2053    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  42.26 
 
 		 1489 aa  944    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  43.16 
 
 		 1424 aa  910    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  42.37 
 
 		 1487 aa  946    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  35.55 
 
 		 1423 aa  657    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  59.07 
 
 		 1463 aa  1502    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  60.65 
 
 		 1441 aa  1529    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  58.82 
 
 		 1451 aa  1454    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  58.75 
 
 		 1463 aa  1511    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  100 
 
 		 1448 aa  2629    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  38.79 
 
 		 1428 aa  651    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1404 aa  426  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  33.18 
 
 		 1869 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  31.7 
 
 		 1500 aa  318  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  29.72 
 
 		 1515 aa  313  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  29.72 
 
 		 1510 aa  312  2.9999999999999997e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  29.34 
 
 		 1578 aa  301  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1538 aa  291  8e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  33.21 
 
 		 2140 aa  256  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  31.96 
 
 		 2032 aa  254  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  22.56 
 
 		 1550 aa  223  3e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  34.74 
 
 		 1276 aa  202  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  34.75 
 
 		 1276 aa  193  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  34.53 
 
 		 1276 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  25.12 
 
 		 1405 aa  181  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  33.96 
 
 		 1084 aa  180  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  28.71 
 
 		 1395 aa  179  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1462 aa  177  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  26.36 
 
 		 1448 aa  164  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1206 aa  159  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  30.2 
 
 		 1335 aa  150  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1319 aa  148  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  29.36 
 
 		 1501 aa  142  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1396 aa  135  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  27.12 
 
 		 1550 aa  132  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  29.98 
 
 		 1392 aa  127  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  42.42 
 
 		 1937 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  31.2 
 
 		 1783 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1270 aa  110  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1221 aa  107  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1224 aa  103  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1406 aa  103  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  27.57 
 
 		 1221 aa  100  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  27.1 
 
 		 1285 aa  96.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1226 aa  95.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1229 aa  94.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1262 aa  94  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1401 aa  92.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1308 aa  89.4  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1223 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  27.32 
 
 		 1304 aa  85.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  28.3 
 
 		 1304 aa  85.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  26.02 
 
 		 1243 aa  84.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1255 aa  84.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  24.97 
 
 		 1224 aa  84.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1325 aa  82.8  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1232 aa  82  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1184 aa  81.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  24.57 
 
 		 1184 aa  81.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1206 aa  81.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  24.97 
 
 		 1224 aa  80.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1453 aa  79.7  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  28.98 
 
 		 1218 aa  78.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1453 aa  78.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  29.05 
 
 		 1299 aa  77.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1434 aa  77.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1392 aa  75.1  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  26.86 
 
 		 1305 aa  75.1  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  26.67 
 
 		 1285 aa  74.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1344 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1341 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  24.75 
 
 		 1344 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1344 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1256 aa  72.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1304 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  26.86 
 
 		 1449 aa  71.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1385 aa  70.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1448 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1398 aa  70.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  33.09 
 
 		 1402 aa  70.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1398 aa  70.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  22.3 
 
 		 1297 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1265 aa  70.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  30.49 
 
 		 1056 aa  69.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  26.74 
 
 		 1273 aa  68.9  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1273 aa  68.9  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1443 aa  68.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1299 aa  68.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1292 aa  68.6  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1352 aa  68.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1226 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1259 aa  67.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  26.3 
 
 		 1485 aa  67  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1319 aa  67  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1435 aa  67  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1174 aa  66.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  27.7 
 
 		 1359 aa  66.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1353 aa  66.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  31.5 
 
 		 1485 aa  63.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1505 aa  64.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>