More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0934 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0934  inner-membrane translocator  100 
 
 		 314 aa  587  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.509235  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  65.29 
 
 		 314 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  65.61 
 
 		 313 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  64.65 
 
 		 314 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  68.15 
 
 		 307 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  66.03 
 
 		 315 aa  381  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  66.45 
 
 		 314 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  66.45 
 
 		 313 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  65.61 
 
 		 314 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  65.08 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  65.08 
 
 		 315 aa  371  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  63.14 
 
 		 313 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  66.24 
 
 		 305 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5334  inner-membrane translocator  67.83 
 
 		 314 aa  360  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3306  inner-membrane translocator  63.17 
 
 		 314 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701348  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3578  inner-membrane translocator  64.13 
 
 		 307 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3992  inner-membrane translocator  64.91 
 
 		 320 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180455  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  42.43 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 306 aa  202  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  43.96 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  39.23 
 
 		 310 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  46.73 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  41.8 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4145  inner-membrane translocator  43.71 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  43.31 
 
 		 308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  42.99 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  39.1 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  42.18 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  41.72 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.42 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  39.17 
 
 		 308 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  40.51 
 
 		 425 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 429 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  42.71 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  40.19 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  36.42 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  41.94 
 
 		 304 aa  165  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  41.24 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  34.88 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  39.23 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  43.57 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  43.53 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  39.36 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  42.95 
 
 		 305 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  39.36 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  39.09 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2684  inner-membrane translocator  42.19 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000451986  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  40.06 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  39.36 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 447 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  42.28 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  37.85 
 
 		 444 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  40.59 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  39.6 
 
 		 435 aa  156  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 313 aa  155  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  34.16 
 
 		 319 aa  155  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  41.99 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 309 aa  155  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  36.95 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  36 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  43.93 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  43.93 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  43.16 
 
 		 305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 440 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  42.76 
 
 		 306 aa  153  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  32.41 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4144  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  32.41 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 319 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  42.03 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 305 aa  149  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 304 aa  149  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  33.64 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  33.64 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  33.64 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  33.64 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  33.33 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.13 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>