170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0996 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  100 
 
 		 216 aa  451  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  37.5 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  37.5 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  34.13 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  36.92 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.79 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  37.31 
 
 		 217 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  37.75 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  36.95 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  37.75 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  38.14 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  35.6 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  30.95 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  35.23 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  42.76 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  37.23 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  34.87 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  35 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  40.1 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.14 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.56 
 
 		 257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  32.43 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  35.11 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  35.35 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  34.04 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  32.64 
 
 		 220 aa  112  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  33.51 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.81 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  32.99 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  32.74 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.65 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  36.65 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  33.51 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  31.94 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  34.9 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  32.74 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  32.52 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  37.24 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  33.99 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  33.16 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  29.8 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  29.8 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  32.14 
 
 		 250 aa  99  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  32.29 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  29.9 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  33.16 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.96 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  33.51 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  31.61 
 
 		 234 aa  92.8  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  27.66 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  32.96 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  38.76 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  34.5 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  37.64 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  30.32 
 
 		 226 aa  85.5  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  32.3 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  33.56 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 297 aa  82  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  34.81 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  33.97 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  30.27 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  32.5 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  33 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.83 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  25.91 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  28.29 
 
 		 233 aa  72  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  32.61 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  31.88 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  34.51 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  29.35 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.75 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  31.21 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.11 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.42 
 
 		 274 aa  62  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  28.65 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.28 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.27 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.62 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  31.97 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  25.41 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.31 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  26.79 
 
 		 278 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0500  endonuclease III  30.08 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.35 
 
 		 356 aa  52  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  27.63 
 
 		 233 aa  51.6  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.79 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1973  HhH-GPD  27.71 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.75329e-18  normal  0.0273848 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0980  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.25 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000905623  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  25.74 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  24.71 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  28.57 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0305  endonuclease III  28.57 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  29.35 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1733  HhH-GPD family protein  29.65 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  26.56 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  26.56 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.77 
 
 		 218 aa  48.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  29.1 
 
 		 286 aa  48.1  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>