72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0662 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  100 
 
 
286 aa  595  1e-169  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  55.87 
 
 
285 aa  311  7.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  52.67 
 
 
285 aa  300  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  46.18 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  41.39 
 
 
283 aa  208  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  39.27 
 
 
279 aa  204  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  37.32 
 
 
299 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  28.78 
 
 
287 aa  176  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  33.57 
 
 
295 aa  175  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  35.23 
 
 
297 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  30.39 
 
 
312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  30.72 
 
 
312 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  34.05 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  31.18 
 
 
300 aa  151  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  35.25 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  31.16 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  28.29 
 
 
336 aa  145  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.29 
 
 
293 aa  142  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  32.13 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  29.76 
 
 
272 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  34.92 
 
 
308 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  32.56 
 
 
307 aa  135  9e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  28.25 
 
 
414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  34.62 
 
 
302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.46 
 
 
334 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  32.48 
 
 
245 aa  116  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.9 
 
 
312 aa  106  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.28 
 
 
312 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  27.55 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.71 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  26.16 
 
 
312 aa  91.3  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  25.63 
 
 
410 aa  87.4  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  24.46 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  26.46 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.71 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.38 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2923  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  24.53 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06530  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  28.12 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.937537 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10840  hypothetical base excision DNA repair protein (Eurofung)  41.03 
 
 
502 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00957228  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  29.1 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2419  AlkA domain protein  22.71 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.839778  hitchhiker  0.00593166 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.53 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 
225 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  24 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  29.7 
 
 
226 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  21.89 
 
 
300 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  31.25 
 
 
232 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.65 
 
 
270 aa  46.2  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  24.57 
 
 
303 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4369  AlkA domain protein  25.96 
 
 
300 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1250  hypothetical protein  22.84 
 
 
298 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.858422 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  30.38 
 
 
216 aa  45.8  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  52.5 
 
 
269 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  24 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  24 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  31.25 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  24 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.15 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  50 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  35.37 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  24 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  38.03 
 
 
226 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  24 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  21.79 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  26.36 
 
 
232 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  29.79 
 
 
221 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  25 
 
 
225 aa  42.7  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  22.73 
 
 
222 aa  42.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4322  alcohol dehydrogenase  20.18 
 
 
495 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.98 
 
 
230 aa  42.4  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  42.5 
 
 
254 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  25.56 
 
 
213 aa  42.4  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>