79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2068 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  100 
 
 		 295 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  59.73 
 
 		 295 aa  358  7e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  53.87 
 
 		 297 aa  323  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  46.15 
 
 		 312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  46.15 
 
 		 312 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  49.13 
 
 		 300 aa  271  9e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  41.13 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  37.55 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  33.57 
 
 		 286 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  37.91 
 
 		 272 aa  172  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  34.78 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  34.89 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  36.19 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  33.45 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  32.35 
 
 		 285 aa  158  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.04 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  37.81 
 
 		 309 aa  142  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  31.19 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  32.74 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  29.78 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  35.42 
 
 		 308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  33.56 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.2 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145682 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  30.94 
 
 		 414 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.9 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  32.19 
 
 		 245 aa  89.7  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  25.91 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  29.05 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.04 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  30.15 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.58 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.87 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.71 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  27.14 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  24.17 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  24.17 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1250  hypothetical protein  25.12 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.858422 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  22.75 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.7 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.7 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.1 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.7 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  24.8 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  24.5 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.22 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.22 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.22 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.22 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  23.72 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.67 
 
 		 240 aa  52.4  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.42 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  21.9 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  29.41 
 
 		 219 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0318  HhH-GPD family protein  25.44 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.536275 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.55 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  30.59 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.78 
 
 		 230 aa  50.4  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  28.57 
 
 		 217 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2923  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  21.07 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 278 aa  48.9  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2950  HhH-GPD family protein  23.53 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296829  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.16 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2712  transcriptional regulator, AraC family protein  23.15 
 
 		 511 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  28.91 
 
 		 237 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  22.97 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  26.47 
 
 		 218 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1665  HhH-GPD family protein  36.92 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4163  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 482 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.813535  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  27.14 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0353  HhH-GPD family protein  23.56 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  34.25 
 
 		 219 aa  43.5  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  29.52 
 
 		 196 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  26.4 
 
 		 210 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10470  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  25.6 
 
 		 234 aa  42.7  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  32.88 
 
 		 232 aa  42.7  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  27.06 
 
 		 224 aa  42.7  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  26.2 
 
 		 233 aa  42.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.48 
 
 		 218 aa  42.4  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24680  DNA-3-methyladenine glycosylase II /DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase /Transcriptional regulator Ada  24.64 
 
 		 536 aa  42.4  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>