79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1517 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  100 
 
 
308 aa  625  1e-178  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  67.31 
 
 
302 aa  385  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  65.91 
 
 
307 aa  380  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  62.58 
 
 
309 aa  363  3e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  61.11 
 
 
293 aa  341  8e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  36.18 
 
 
285 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  34.92 
 
 
286 aa  150  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  34.44 
 
 
283 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  34.38 
 
 
299 aa  142  9e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  29.73 
 
 
284 aa  139  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  25.67 
 
 
287 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  32.88 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  33.19 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  30.98 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  30.33 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  26.27 
 
 
312 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  26.27 
 
 
312 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  27.69 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  31.08 
 
 
414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  33.17 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.78 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  34.58 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.06 
 
 
295 aa  105  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  29.88 
 
 
336 aa  104  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  27.6 
 
 
312 aa  103  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.1 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.45 
 
 
312 aa  99.4  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  32.22 
 
 
245 aa  95.5  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30.5 
 
 
306 aa  92.4  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  26.52 
 
 
311 aa  87  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  26.96 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  23.44 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.37 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.09 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  26.03 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2923  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  23.08 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  28.07 
 
 
300 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.06 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  25.22 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.59 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.71 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.42 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.38 
 
 
303 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.38 
 
 
303 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.38 
 
 
303 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0318  HhH-GPD family protein  27.51 
 
 
301 aa  62.4  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.536275 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.9 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.99 
 
 
288 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.11 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.06 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0783  HhH-GPD family protein  30.57 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.11 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0775  HhH-GPD family protein  29.9 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  30.72 
 
 
198 aa  50.1  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1527  HhH-GPD family protein  27.56 
 
 
322 aa  49.7  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0472301  normal  0.34415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1848  base excision repair protein, HhH-GPD family  27.56 
 
 
322 aa  49.7  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  30.53 
 
 
217 aa  49.3  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0738  HhH-GPD  29.38 
 
 
309 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00497967  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0353  HhH-GPD family protein  24.05 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3470  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 
523 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884533  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  40.58 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2940  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 
565 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.91789  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2800  alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 
565 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1557  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 
565 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.486878  hitchhiker  0.00513105 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2712  transcriptional regulator, AraC family protein  26.45 
 
 
511 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1477  HhH-GPD family protein  30.11 
 
 
199 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  27.02 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06530  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  29.95 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.937537 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  24.26 
 
 
287 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2820  alcohol dehydrogenase  28.68 
 
 
565 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.04 
 
 
287 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2497  alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 
563 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  24.04 
 
 
205 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  34.94 
 
 
202 aa  43.5  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2665  HhH-GPD family protein  28.4 
 
 
201 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2269  HhH-GPD family protein  27.03 
 
 
207 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309984  normal  0.119846 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2531  Ada, metal-binding  29.73 
 
 
545 aa  42.7  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.645313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  28.1 
 
 
233 aa  42.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2950  HhH-GPD family protein  25.58 
 
 
300 aa  42.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296829  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>