66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1267 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 287 aa  600  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  52.61 
 
 		 312 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  46.85 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  47.9 
 
 		 311 aa  288  7e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  46.64 
 
 		 312 aa  278  7e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  53.78 
 
 		 313 aa  275  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  44.95 
 
 		 312 aa  275  8e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  32.98 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  27.54 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.24 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.84 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  30.43 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  26.81 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  29.79 
 
 		 300 aa  86.3  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  28.34 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  28.57 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30.3 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  28.76 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.3 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  26.4 
 
 		 414 aa  75.5  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30.05 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.12 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.05 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  26.64 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  26.32 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.59 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  26.7 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.82 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  26.7 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  27.14 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  26.46 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.12 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2505  putative transcription regulator protein  26.18 
 
 		 490 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0201165 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  28.86 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  22.27 
 
 		 410 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4053  HhH-GPD family protein  26.77 
 
 		 330 aa  52.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2326  alcohol dehydrogenase  29.3 
 
 		 503 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.89 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.17 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  28.38 
 
 		 309 aa  49.3  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  30.43 
 
 		 287 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0541  endonuclease III domain protein  29.71 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0403  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.58 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0471  endonuclease III domain protein  29.58 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0541  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  29.71 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256846  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.33 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3301  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  26.64 
 
 		 494 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0977453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0413  DNA-3-methyladenine glycosylase II, C-terminus  29.58 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  55 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2773  transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 		 491 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0490  endonuclease III domain protein  28.87 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  45.28 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0399  DNA-3-methyladenine glycosylase II (3-methyladenine-DNA glycosidase)  29.71 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4322  alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 		 495 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4833  endonuclease III domain protein  28.37 
 
 		 287 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0044  Ada metal-binding domain-containing protein  33.76 
 
 		 513 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  29.11 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1107  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 502 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0739915 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3749  endonuclease III  38.95 
 
 		 230 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  38.95 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7756  transcriptional regulator, AraC family  34.75 
 
 		 564 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3183  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.48 
 
 		 225 aa  43.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1004  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  30.21 
 
 		 216 aa  43.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.557567  normal  0.350835 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1486  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.79 
 
 		 230 aa  43.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.253605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  29.45 
 
 		 217 aa  42.7  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  28.05 
 
 		 210 aa  42.7  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>