71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1472 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  624  1e-178  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  48.2 
 
 		 285 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  46.18 
 
 		 286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  47.06 
 
 		 285 aa  250  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  39.33 
 
 		 299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  43.91 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  33.7 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  37.87 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  36.56 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  36.19 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  35.19 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  33.12 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  32.8 
 
 		 312 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  36.86 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  33.1 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  28.62 
 
 		 336 aa  139  3.9999999999999997e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  33.21 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.9 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  32.08 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  32.65 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  32.27 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.86 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  37.17 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  28.52 
 
 		 272 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  34.03 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.95 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.14 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  28.04 
 
 		 312 aa  93.6  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.55 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  26.22 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  30.43 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  30.17 
 
 		 245 aa  88.2  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  25.89 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.08 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1250  hypothetical protein  24.77 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.858422 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.45 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.38 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  26.83 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  24.07 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  24.07 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  24.07 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.43 
 
 		 288 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.94 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.61 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1888  alcohol dehydrogenase  24.44 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753852  normal  0.559526 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.08 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.66 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.61 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  24 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  53.85 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  51.28 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.94 
 
 		 303 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  23 
 
 		 303 aa  45.8  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11344  Ada regulatory protein alkA  25.11 
 
 		 496 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.334528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.61 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.22 
 
 		 218 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.06 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.79 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.5 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  25.14 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  23.86 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0471  endonuclease III domain protein  25.7 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0403  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.7 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  29.79 
 
 		 225 aa  43.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0413  DNA-3-methyladenine glycosylase II, C-terminus  25.7 
 
 		 213 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10840  hypothetical base excision DNA repair protein (Eurofung)  39.68 
 
 		 502 aa  42.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00957228  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  26.62 
 
 		 219 aa  42.7  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  37.5 
 
 		 218 aa  42.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.36 
 
 		 303 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  25.99 
 
 		 330 aa  42.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>