More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1779 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  100 
 
 		 301 aa  584  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  31.42 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  29.02 
 
 		 303 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  29.29 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  29.64 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0318  HhH-GPD family protein  30.28 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.536275 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  29.02 
 
 		 303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  29.02 
 
 		 303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  29.02 
 
 		 303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2923  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.18 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  29.64 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.93 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  29.5 
 
 		 303 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.73 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  34.36 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1389  HhH-GPD family protein  34.36 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.0527923 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  32.99 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.85 
 
 		 221 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  35.2 
 
 		 256 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  32.7 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.85 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  33.85 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  33.85 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.85 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3755  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 489 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051726  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.85 
 
 		 295 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  33.85 
 
 		 312 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  33.67 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  34.18 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3470  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 523 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884533  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0399  DNA-3-methyladenine glycosylase II (3-methyladenine-DNA glycosidase)  34.41 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1009  HhH-GPD family protein  32.49 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.05 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.67 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.67 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.67 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  33.67 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2950  HhH-GPD family protein  31.67 
 
 		 300 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296829  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  28.81 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0541  endonuclease III domain protein  33.16 
 
 		 287 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  33.85 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  31.77 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  32.31 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  33.16 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  32.31 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.25 
 
 		 206 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0471  endonuclease III domain protein  32.63 
 
 		 287 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0413  DNA-3-methyladenine glycosylase II, C-terminus  32.63 
 
 		 213 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0403  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.63 
 
 		 287 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4833  endonuclease III domain protein  32.11 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  34.56 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0490  endonuclease III domain protein  32.11 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  35.77 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  31.98 
 
 		 223 aa  100  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  30.54 
 
 		 309 aa  99  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0541  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  32.26 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256846  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0044  Ada metal-binding domain-containing protein  29.51 
 
 		 513 aa  97.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32 
 
 		 288 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  33.85 
 
 		 205 aa  95.9  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2163  HhH-GPD family protein  35.78 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  32.65 
 
 		 218 aa  93.6  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2427  HhH-GPD family protein  34.39 
 
 		 368 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.610261  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0595  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  30 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  33.85 
 
 		 202 aa  92.8  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  33.33 
 
 		 232 aa  92  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  32.56 
 
 		 210 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3357  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  32.63 
 
 		 486 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5912  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  35.16 
 
 		 500 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1593  base-excision DNA repair protein  33.78 
 
 		 219 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  37.43 
 
 		 210 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1219  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 492 aa  90.5  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.627471  normal  0.0317838 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  34.25 
 
 		 219 aa  89.7  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1213  HhH-GPD  34.98 
 
 		 297 aa  89.7  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.235749  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.34 
 
 		 217 aa  89.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28630  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  32.77 
 
 		 324 aa  89  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.387023  normal  0.162457 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.33 
 
 		 199 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2326  alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 		 503 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1350  HhH-GPD  29.08 
 
 		 216 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  31 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2892  HhH-GPD family protein  31.16 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  hitchhiker  0.00930162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  28.57 
 
 		 234 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24680  DNA-3-methyladenine glycosylase II /DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase /Transcriptional regulator Ada  35.95 
 
 		 536 aa  87.4  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0057  transcriptional regulator, AraC family  36.82 
 
 		 579 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1157  HhH-GPD  35.96 
 
 		 210 aa  87  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.018776 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  34.86 
 
 		 208 aa  86.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4133  transcriptional regulator, AraC family  35.69 
 
 		 484 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0495  HhH-GPD family protein  34.32 
 
 		 231 aa  86.7  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.65814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1101  Ada metal-binding domain-containing protein  34.82 
 
 		 511 aa  86.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12283  normal  0.610277 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04389  DNA-3-methyladenine glycosylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06800)  32.98 
 
 		 391 aa  86.3  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.57 
 
 		 288 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4002  DNA-3-methyladenine glycosidase II  38.33 
 
 		 217 aa  85.9  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2864  HhH-GPD  27.8 
 
 		 231 aa  85.5  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  34.69 
 
 		 205 aa  85.5  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  36.55 
 
 		 207 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  34.74 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5315  transcriptional regulator Ada  35.86 
 
 		 509 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1848  base excision repair protein, HhH-GPD family  29.79 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1527  HhH-GPD family protein  29.79 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0472301  normal  0.34415 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0948  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  27.53 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.91 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>