250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2892 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2892  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 246 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  hitchhiker  0.00930162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2864  HhH-GPD  73.75 
 
 		 231 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1350  HhH-GPD  80.61 
 
 		 216 aa  346  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  77.27 
 
 		 234 aa  332  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3089  HhH-GPD family protein  76.26 
 
 		 217 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  75.25 
 
 		 219 aa  318  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2090  HhH-GPD family protein  72.22 
 
 		 219 aa  311  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1624  HhH-GPD family protein  71.72 
 
 		 219 aa  310  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2508  HhH-GPD family protein  70.65 
 
 		 269 aa  309  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1671  HhH-GPD family protein  71.29 
 
 		 216 aa  293  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  67.8 
 
 		 217 aa  291  6e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  64.65 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  63.64 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  58.33 
 
 		 223 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  56.07 
 
 		 290 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1009  HhH-GPD family protein  61 
 
 		 290 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  61.5 
 
 		 291 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  61.31 
 
 		 218 aa  265  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  60.1 
 
 		 312 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  60.1 
 
 		 312 aa  262  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  60.1 
 
 		 312 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  60.1 
 
 		 312 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  60.1 
 
 		 312 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1389  HhH-GPD family protein  57.34 
 
 		 340 aa  262  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.0527923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  60.61 
 
 		 349 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  60.1 
 
 		 312 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  60.1 
 
 		 295 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  60.1 
 
 		 221 aa  261  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  61.42 
 
 		 293 aa  258  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  60.1 
 
 		 281 aa  258  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  57.47 
 
 		 275 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  60.91 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  58.77 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  58.77 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  58.06 
 
 		 287 aa  254  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  57.53 
 
 		 287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  53.03 
 
 		 205 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  52.24 
 
 		 208 aa  206  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  39.9 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.39 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  40.43 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0630  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.34 
 
 		 186 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000706264  normal  0.223656 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  37.84 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3495  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.68 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482188 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10470  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  34.33 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  35.98 
 
 		 209 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  36.51 
 
 		 196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  30.89 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3244  HhH-GPD family protein  32.99 
 
 		 198 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  36.17 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2269  HhH-GPD family protein  36.95 
 
 		 207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309984  normal  0.119846 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  32.7 
 
 		 202 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  34.72 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  38.27 
 
 		 207 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  33.16 
 
 		 210 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04389  DNA-3-methyladenine glycosylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06800)  31.51 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2525  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0239966 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.44 
 
 		 163 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  32.79 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.18 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0738  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.34 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2427  HhH-GPD family protein  32.97 
 
 		 368 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.610261  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.84 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545476  normal  0.965549 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0495  HhH-GPD family protein  32.95 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.65814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.99 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1159  HhH-GPD family protein  28.96 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000451555  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0739  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.67 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0107  HhH-GPD  39.24 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2156  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.84 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  34.04 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04456  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.68 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0790  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.77 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46865  predicted protein  30.71 
 
 		 394 aa  102  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259126  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4478  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.84 
 
 		 208 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.795178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.16 
 
 		 288 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.92 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04530  DNA-3-methyladenine glycosidase, putative  41.67 
 
 		 461 aa  101  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0291  HhH-GPD family protein  31.91 
 
 		 190 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000526477  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.41 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0855  HhH-GPD family protein  35.22 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.908552 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0399  DNA-3-methyladenine glycosylase II (3-methyladenine-DNA glycosidase)  31.58 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1026  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.67 
 
 		 220 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1486  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.83 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.253605 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  29.15 
 
 		 219 aa  99  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2841  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.37 
 
 		 216 aa  98.6  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2435  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.37 
 
 		 216 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  32.16 
 
 		 287 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  31.96 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0490  endonuclease III domain protein  31.58 
 
 		 287 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3766  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.32 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0541  endonuclease III domain protein  30.99 
 
 		 287 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  32.99 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0684  DNA-3-methyladenine glycosidase  36.32 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0413  DNA-3-methyladenine glycosylase II, C-terminus  30.99 
 
 		 213 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2016  base excision DNA repair protein  32.31 
 
 		 203 aa  96.3  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0541  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  31.58 
 
 		 287 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0403  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.99 
 
 		 287 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2387  HhH-GPD family protein  32.31 
 
 		 203 aa  96.3  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0471  endonuclease III domain protein  30.99 
 
 		 287 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2288  base excision DNA repair protein  32.31 
 
 		 203 aa  96.3  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>