274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3657 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  100 
 
 
199 aa  400  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  43.23 
 
 
205 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.03 
 
 
217 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  39.69 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  40.82 
 
 
210 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  41.27 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  40.84 
 
 
218 aa  144  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  39.79 
 
 
223 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  40.21 
 
 
206 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2892  HhH-GPD family protein  40.43 
 
 
246 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  hitchhiker  0.00930162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  40.21 
 
 
206 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.42 
 
 
221 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  38.42 
 
 
312 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.42 
 
 
312 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1350  HhH-GPD  38.95 
 
 
216 aa  142  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1026  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.8 
 
 
220 aa  142  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.42 
 
 
312 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.42 
 
 
295 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  38.42 
 
 
312 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  38.42 
 
 
312 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  38.42 
 
 
312 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  41.49 
 
 
208 aa  140  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0790  DNA-3-methyladenine glycosylase II  38.97 
 
 
220 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  42.86 
 
 
198 aa  139  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  41.36 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3089  HhH-GPD family protein  38.42 
 
 
217 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  37.89 
 
 
256 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  39.15 
 
 
234 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04456  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.71 
 
 
224 aa  136  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2864  HhH-GPD  38.3 
 
 
231 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  37.37 
 
 
261 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1671  HhH-GPD family protein  38.66 
 
 
216 aa  135  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2427  HhH-GPD family protein  39.58 
 
 
368 aa  135  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.610261  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10470  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  37.7 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  37.37 
 
 
291 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1009  HhH-GPD family protein  36.32 
 
 
290 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.8 
 
 
251 aa  131  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  44.51 
 
 
205 aa  131  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0495  HhH-GPD family protein  40.53 
 
 
231 aa  131  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.65814  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  35.26 
 
 
349 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  36.32 
 
 
290 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1624  HhH-GPD family protein  35.79 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3244  HhH-GPD family protein  37.23 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  37.17 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  35.26 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3766  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.27 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  40.33 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  35.26 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2090  HhH-GPD family protein  35.79 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  37.57 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  34.74 
 
 
275 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.74 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.74 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.74 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  40.11 
 
 
209 aa  128  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  34.21 
 
 
293 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0630  DNA-3-methyladenine glycosylase II  40.78 
 
 
186 aa  127  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000706264  normal  0.223656 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1157  HhH-GPD  41.36 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.018776 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  34.74 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3255  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.31 
 
 
224 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00136627  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  45.1 
 
 
163 aa  125  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1385  HhH-GPD family protein  40.61 
 
 
209 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499849  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1389  HhH-GPD family protein  34.74 
 
 
340 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.0527923 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  38.92 
 
 
209 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0684  DNA-3-methyladenine glycosidase  40.82 
 
 
226 aa  124  9e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0601  HhH-GPD family protein  40.82 
 
 
226 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4930  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.31 
 
 
214 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2508  HhH-GPD family protein  35.45 
 
 
269 aa  123  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1159  HhH-GPD family protein  34.55 
 
 
235 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000451555  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  38.67 
 
 
202 aa  123  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  40.1 
 
 
210 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase II  38.27 
 
 
208 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545476  normal  0.965549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0738  DNA-3-methyladenine glycosylase II  38.27 
 
 
207 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0547  DNA-3-methyladenine glycosylase II  38.38 
 
 
212 aa  122  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3495  DNA-3-methyladenine glycosylase II  40.83 
 
 
220 aa  121  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2727  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  40.61 
 
 
209 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  40.32 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1846  HhH-GPD family protein  38.42 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1486  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.58 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.253605 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04389  DNA-3-methyladenine glycosylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06800)  32.14 
 
 
391 aa  119  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2435  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.95 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  34.03 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  44.94 
 
 
195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0739  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.62 
 
 
208 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2665  HhH-GPD family protein  34.36 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1445  HhH-GPD  37.97 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0863627  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4478  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.9 
 
 
208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.795178 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0291  HhH-GPD family protein  34.81 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000526477  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2156  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.5 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2841  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.47 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3124  HhH-GPD family protein  42.63 
 
 
249 aa  112  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3183  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35 
 
 
225 aa  111  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1134  putative DNA-3-methyladenine glycosidase  34.34 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2569  DNA-3-methyladenine glycosylase protein  36.14 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0107  HhH-GPD  40.12 
 
 
216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  37.82 
 
 
219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3554  HhH-GPD family protein  35.26 
 
 
214 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  35.79 
 
 
232 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3847  HhH-GPD family protein  34.74 
 
 
214 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583366  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4886  HhH-GPD  33.84 
 
 
220 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301844  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>