252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1159 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1159  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 235 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000451555  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  59.43 
 
 		 219 aa  266  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  56.28 
 
 		 201 aa  250  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10470  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  51.9 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2525  HhH-GPD family protein  54.82 
 
 		 201 aa  215  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0239966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3244  HhH-GPD family protein  48.47 
 
 		 198 aa  204  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2016  base excision DNA repair protein  50.51 
 
 		 203 aa  188  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2288  base excision DNA repair protein  50.51 
 
 		 203 aa  188  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2387  HhH-GPD family protein  50.51 
 
 		 203 aa  188  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  35.52 
 
 		 205 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  33.85 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.55 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  32.66 
 
 		 349 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  34.24 
 
 		 205 aa  118  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  33.33 
 
 		 281 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  33.85 
 
 		 312 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.85 
 
 		 312 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.85 
 
 		 312 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.85 
 
 		 295 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  33.85 
 
 		 312 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  33.85 
 
 		 312 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.85 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  33.85 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2269  HhH-GPD family protein  36.46 
 
 		 207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309984  normal  0.119846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  37.97 
 
 		 207 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  34.55 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0107  HhH-GPD  34.76 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.29 
 
 		 275 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  32.79 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.29 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  32.29 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.29 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.97 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  30.89 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0495  HhH-GPD family protein  37.89 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.65814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  38.61 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0790  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.68 
 
 		 220 aa  108  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1009  HhH-GPD family protein  32.12 
 
 		 290 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  32.12 
 
 		 290 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  31.69 
 
 		 234 aa  108  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1389  HhH-GPD family protein  30.37 
 
 		 340 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.0527923 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  30.89 
 
 		 293 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  33.7 
 
 		 205 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  35.75 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1671  HhH-GPD family protein  31.55 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  32.46 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  31.77 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.46 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  32.47 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2864  HhH-GPD  30.81 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.96 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.18 
 
 		 163 aa  105  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1445  HhH-GPD  34.05 
 
 		 219 aa  105  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0863627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  32.61 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1157  HhH-GPD  35.29 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.018776 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2892  HhH-GPD family protein  28.96 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  hitchhiker  0.00930162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1350  HhH-GPD  30.05 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3089  HhH-GPD family protein  30.73 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04456  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.5 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0291  HhH-GPD family protein  31.11 
 
 		 190 aa  102  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000526477  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  31.15 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1026  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.68 
 
 		 220 aa  102  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0630  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.71 
 
 		 186 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000706264  normal  0.223656 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2427  HhH-GPD family protein  32.61 
 
 		 368 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.610261  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  30.57 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3255  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.02 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00136627  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1486  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.03 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.253605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  28.1 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4478  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.94 
 
 		 208 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.795178 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04530  DNA-3-methyladenine glycosidase, putative  42.11 
 
 		 461 aa  97.4  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  31.55 
 
 		 287 aa  96.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  32.53 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2508  HhH-GPD family protein  30.05 
 
 		 269 aa  96.3  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.14 
 
 		 287 aa  95.5  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  29.78 
 
 		 202 aa  94.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  30.05 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  28.96 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0855  HhH-GPD family protein  31.02 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.908552 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1385  HhH-GPD family protein  36.56 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2156  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.68 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2727  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  36.22 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0601  HhH-GPD family protein  31.28 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2090  HhH-GPD family protein  27.6 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1624  HhH-GPD family protein  27.6 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  31.69 
 
 		 196 aa  92.8  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  36.24 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4833  endonuclease III domain protein  30.36 
 
 		 287 aa  92  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3183  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.7 
 
 		 225 aa  92.4  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  31.61 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0490  endonuclease III domain protein  30.36 
 
 		 287 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2569  DNA-3-methyladenine glycosylase protein  31.82 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  31.21 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4930  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.5 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.16 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545476  normal  0.965549 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0399  DNA-3-methyladenine glycosylase II (3-methyladenine-DNA glycosidase)  29.17 
 
 		 287 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0738  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.16 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0541  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  29.76 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0541  endonuclease III domain protein  29.76 
 
 		 287 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1593  base-excision DNA repair protein  31.21 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>