268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04456 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04456  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 		 224 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0684  DNA-3-methyladenine glycosidase  66.82 
 
 		 226 aa  291  4e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0601  HhH-GPD family protein  62.67 
 
 		 226 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  42.11 
 
 		 209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.72 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.34 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545476  normal  0.965549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0738  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.34 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  42.71 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1486  DNA-3-methyladenine glycosylase II  40.31 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.253605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2435  DNA-3-methyladenine glycosylase II  40.22 
 
 		 216 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2569  DNA-3-methyladenine glycosylase protein  39.67 
 
 		 212 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4930  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.67 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0630  DNA-3-methyladenine glycosylase II  41.62 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000706264  normal  0.223656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0739  DNA-3-methyladenine glycosylase II  38 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3766  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.13 
 
 		 218 aa  131  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2841  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.13 
 
 		 216 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2156  DNA-3-methyladenine glycosylase II  38.59 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0790  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.8 
 
 		 220 aa  128  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1026  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.33 
 
 		 220 aa  125  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4478  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.07 
 
 		 208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.795178 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3183  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.44 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3495  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.25 
 
 		 220 aa  118  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  34.13 
 
 		 210 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3255  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.15 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00136627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3366  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.65 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  42.14 
 
 		 163 aa  115  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.45 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  43.35 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  43.83 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0547  DNA-3-methyladenine glycosylase II  40 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  36.18 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1299  DNA-3-methyladenine glycosylase II  48.33 
 
 		 142 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0767189  normal  0.0206516 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  31.86 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.86 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0495  HhH-GPD family protein  38.22 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.65814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0291  HhH-GPD family protein  34.17 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000526477  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0107  HhH-GPD  38.38 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2892  HhH-GPD family protein  35.68 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  hitchhiker  0.00930162 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1159  HhH-GPD family protein  33.5 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000451555  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.47 
 
 		 288 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  40.45 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  34.67 
 
 		 349 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1671  HhH-GPD family protein  34.85 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  32.67 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.82 
 
 		 312 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  34.83 
 
 		 281 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  37.13 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  37.95 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2269  HhH-GPD family protein  36.76 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309984  normal  0.119846 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  34.33 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.83 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  33 
 
 		 293 aa  99.4  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1009  HhH-GPD family protein  37.35 
 
 		 290 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0855  HhH-GPD family protein  30.88 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.908552 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  33.83 
 
 		 312 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  36.14 
 
 		 261 aa  99  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.33 
 
 		 312 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  33.33 
 
 		 312 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  33.33 
 
 		 312 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.83 
 
 		 295 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  35.79 
 
 		 198 aa  98.6  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  35.5 
 
 		 291 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3089  HhH-GPD family protein  35.92 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.35 
 
 		 288 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1350  HhH-GPD  32.84 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1445  HhH-GPD  34.91 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0863627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3244  HhH-GPD family protein  30.61 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  34.15 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  32.18 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  34.87 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2864  HhH-GPD  33.33 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32 
 
 		 275 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32 
 
 		 275 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32 
 
 		 275 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  32 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1389  HhH-GPD family protein  31.07 
 
 		 340 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.0527923 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2508  HhH-GPD family protein  34.47 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  32 
 
 		 287 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  33.84 
 
 		 205 aa  92  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  32.86 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  31.5 
 
 		 287 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10470  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  29.41 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  30.61 
 
 		 201 aa  89  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  33.14 
 
 		 209 aa  87.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04389  DNA-3-methyladenine glycosylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06800)  28.69 
 
 		 391 aa  86.3  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  31.76 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.59 
 
 		 287 aa  85.5  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  29.8 
 
 		 202 aa  85.5  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2016  base excision DNA repair protein  29.85 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2387  HhH-GPD family protein  29.85 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2288  base excision DNA repair protein  29.85 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1624  HhH-GPD family protein  29.8 
 
 		 219 aa  85.1  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2090  HhH-GPD family protein  29.8 
 
 		 219 aa  84.7  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72517  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  34.15 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1846  HhH-GPD family protein  33.66 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2665  HhH-GPD family protein  31.18 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  30.1 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0541  endonuclease III domain protein  31.18 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2525  HhH-GPD family protein  29.76 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0239966 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0399  DNA-3-methyladenine glycosylase II (3-methyladenine-DNA glycosidase)  30 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>