261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2525 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2525  HhH-GPD family protein  100 
 
 
201 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0239966 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  66.67 
 
 
201 aa  298  5e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  57.87 
 
 
219 aa  258  6e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1159  HhH-GPD family protein  54.82 
 
 
235 aa  238  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000451555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3244  HhH-GPD family protein  55.05 
 
 
198 aa  227  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10470  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  49.25 
 
 
234 aa  214  7e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2288  base excision DNA repair protein  53.85 
 
 
203 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2016  base excision DNA repair protein  53.85 
 
 
203 aa  209  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2387  HhH-GPD family protein  53.85 
 
 
203 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0107  HhH-GPD  34.62 
 
 
216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.91 
 
 
199 aa  114  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0630  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.42 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000706264  normal  0.223656 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  32.8 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2892  HhH-GPD family protein  32.07 
 
 
246 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  hitchhiker  0.00930162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3089  HhH-GPD family protein  30.3 
 
 
217 aa  111  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  34.36 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1350  HhH-GPD  30.98 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  32.79 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  34.24 
 
 
207 aa  107  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  31.15 
 
 
256 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  30.89 
 
 
291 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  31.02 
 
 
223 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  31.05 
 
 
205 aa  105  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  30.89 
 
 
290 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.55 
 
 
163 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1009  HhH-GPD family protein  30.89 
 
 
290 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  33.54 
 
 
209 aa  105  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0855  HhH-GPD family protein  35.08 
 
 
206 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.908552 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  31.02 
 
 
218 aa  105  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2864  HhH-GPD  29.89 
 
 
231 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.51 
 
 
221 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  29.51 
 
 
234 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2508  HhH-GPD family protein  28.42 
 
 
269 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.51 
 
 
295 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  29.51 
 
 
312 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.51 
 
 
312 aa  101  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  27.72 
 
 
219 aa  101  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.51 
 
 
312 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  29.51 
 
 
312 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  29.51 
 
 
312 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.57 
 
 
217 aa  101  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  33.15 
 
 
196 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  30 
 
 
202 aa  100  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  29.51 
 
 
312 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  27.87 
 
 
275 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.87 
 
 
275 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  27.87 
 
 
281 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.87 
 
 
275 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.87 
 
 
275 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  28.42 
 
 
349 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  27.87 
 
 
287 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2090  HhH-GPD family protein  26.04 
 
 
219 aa  99  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72517  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1671  HhH-GPD family protein  27.66 
 
 
216 aa  98.6  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  29.56 
 
 
208 aa  98.2  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  30.95 
 
 
287 aa  98.2  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  32.62 
 
 
206 aa  98.2  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  27.87 
 
 
293 aa  98.2  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0790  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.76 
 
 
220 aa  97.8  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0413  DNA-3-methyladenine glycosylase II, C-terminus  31.55 
 
 
213 aa  97.8  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2269  HhH-GPD family protein  33.73 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309984  normal  0.119846 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.62 
 
 
206 aa  97.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2569  DNA-3-methyladenine glycosylase protein  30.81 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0291  HhH-GPD family protein  29.12 
 
 
190 aa  97.8  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000526477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0403  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.55 
 
 
287 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  28.96 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1157  HhH-GPD  30.27 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.018776 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0471  endonuclease III domain protein  31.55 
 
 
287 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1624  HhH-GPD family protein  25.52 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1389  HhH-GPD family protein  27.87 
 
 
340 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.0527923 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1026  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.98 
 
 
220 aa  96.3  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  33.12 
 
 
195 aa  96.3  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  27.32 
 
 
287 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0541  endonuclease III domain protein  30.95 
 
 
287 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4833  endonuclease III domain protein  30.95 
 
 
287 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00136763  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.76 
 
 
287 aa  95.1  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0399  DNA-3-methyladenine glycosylase II (3-methyladenine-DNA glycosidase)  29.76 
 
 
287 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  31.35 
 
 
210 aa  94.7  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  29.47 
 
 
205 aa  94.7  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3766  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.64 
 
 
218 aa  94.4  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0490  endonuclease III domain protein  29.76 
 
 
287 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  28.8 
 
 
198 aa  94  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3847  HhH-GPD family protein  28.65 
 
 
214 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583366  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1477  HhH-GPD family protein  29.79 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2665  HhH-GPD family protein  28.21 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0495  HhH-GPD family protein  32.48 
 
 
231 aa  92.4  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.65814  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4930  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.96 
 
 
214 aa  92  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3255  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.47 
 
 
224 aa  91.7  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00136627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0541  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  29.17 
 
 
287 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256846  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2435  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.72 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.54 
 
 
288 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4478  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.93 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.795178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.14 
 
 
288 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04530  DNA-3-methyladenine glycosidase, putative  34.93 
 
 
461 aa  89.4  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2841  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.72 
 
 
216 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.43 
 
 
251 aa  88.2  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3554  HhH-GPD family protein  27.42 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  26.75 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  23.81 
 
 
232 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04456  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.15 
 
 
224 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.5 
 
 
208 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545476  normal  0.965549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>