More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0405 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 287 aa  595  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0541  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  94.43 
 
 		 287 aa  565  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4833  endonuclease III domain protein  91.99 
 
 		 287 aa  554  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0490  endonuclease III domain protein  91.99 
 
 		 287 aa  555  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0471  endonuclease III domain protein  92.33 
 
 		 287 aa  552  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0403  DNA-3-methyladenine glycosylase II  92.33 
 
 		 287 aa  552  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0399  DNA-3-methyladenine glycosylase II (3-methyladenine-DNA glycosidase)  91.64 
 
 		 287 aa  551  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0541  endonuclease III domain protein  91.64 
 
 		 287 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  79.09 
 
 		 287 aa  496  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0413  DNA-3-methyladenine glycosylase II, C-terminus  90.61 
 
 		 213 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  46.53 
 
 		 288 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  44.79 
 
 		 288 aa  269  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0412  DNA-3-methyladenine glycosylase II, N-terminus  98.39 
 
 		 62 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0630  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.92 
 
 		 186 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000706264  normal  0.223656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0318  HhH-GPD family protein  36.62 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.536275 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  30.73 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  37.5 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  33.17 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.87 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3755  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 489 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.49 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3470  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 523 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884533  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  32.68 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  36.57 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2923  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  32.47 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  36.57 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0790  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.41 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  31.25 
 
 		 207 aa  102  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  32.2 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  32.68 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  33.33 
 
 		 208 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  32.2 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  32.2 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1026  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.82 
 
 		 220 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  27.8 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  32.54 
 
 		 195 aa  99.8  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  31.53 
 
 		 303 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  29.63 
 
 		 256 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  30.09 
 
 		 261 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2525  HhH-GPD family protein  30.95 
 
 		 201 aa  98.6  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0239966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3089  HhH-GPD family protein  31.61 
 
 		 217 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2508  HhH-GPD family protein  28.72 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.52 
 
 		 163 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2892  HhH-GPD family protein  32.16 
 
 		 246 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  hitchhiker  0.00930162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0855  HhH-GPD family protein  35.54 
 
 		 206 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.908552 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  30.99 
 
 		 234 aa  96.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1159  HhH-GPD family protein  31.55 
 
 		 235 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000451555  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  30.73 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  32.74 
 
 		 219 aa  95.5  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04389  DNA-3-methyladenine glycosylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06800)  30.65 
 
 		 391 aa  95.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1350  HhH-GPD  29.89 
 
 		 216 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  28.57 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1624  HhH-GPD family protein  28.71 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3495  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.82 
 
 		 220 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482188 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1009  HhH-GPD family protein  30.73 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  27.89 
 
 		 202 aa  94.7  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2090  HhH-GPD family protein  28.71 
 
 		 219 aa  94.7  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2864  HhH-GPD  30.99 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0291  HhH-GPD family protein  27.23 
 
 		 190 aa  93.6  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000526477  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3183  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.34 
 
 		 225 aa  93.2  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  31.38 
 
 		 223 aa  93.2  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04530  DNA-3-methyladenine glycosidase, putative  36.03 
 
 		 461 aa  92.4  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  29.27 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3255  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.14 
 
 		 224 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00136627  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  28.5 
 
 		 198 aa  91.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2427  HhH-GPD family protein  27.87 
 
 		 368 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.610261  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0044  Ada metal-binding domain-containing protein  24.91 
 
 		 513 aa  90.5  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.13 
 
 		 221 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  29.26 
 
 		 281 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  30.36 
 
 		 201 aa  89.7  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.93 
 
 		 199 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.13 
 
 		 312 aa  89.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  27.24 
 
 		 312 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  27.24 
 
 		 312 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.24 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  28.19 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  27.24 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  27.24 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.24 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  31.36 
 
 		 210 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1486  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.16 
 
 		 230 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.253605 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  26.83 
 
 		 217 aa  86.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.89 
 
 		 251 aa  86.7  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  26.09 
 
 		 206 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  29.26 
 
 		 275 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.91 
 
 		 275 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  29.26 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.91 
 
 		 275 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.91 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.09 
 
 		 206 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  28.19 
 
 		 202 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  28.19 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3847  HhH-GPD family protein  27.66 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2665  HhH-GPD family protein  28.64 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10470  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  30 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3554  HhH-GPD family protein  27.66 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  28.19 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1671  HhH-GPD family protein  28.07 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1157  HhH-GPD  27.75 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.018776 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  30.18 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>