284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3495 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3495  DNA-3-methyladenine glycosylase II  100 
 
 
220 aa  436  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  45.33 
 
 
251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase II  48.48 
 
 
208 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545476  normal  0.965549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0738  DNA-3-methyladenine glycosylase II  48.48 
 
 
207 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0739  DNA-3-methyladenine glycosylase II  44.9 
 
 
208 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0790  DNA-3-methyladenine glycosylase II  40.1 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.03 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  41.01 
 
 
290 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1009  HhH-GPD family protein  40.45 
 
 
290 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1026  DNA-3-methyladenine glycosylase II  43.45 
 
 
220 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0630  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.16 
 
 
186 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000706264  normal  0.223656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4478  DNA-3-methyladenine glycosylase II  46.06 
 
 
208 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.795178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1671  HhH-GPD family protein  42.63 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2435  DNA-3-methyladenine glycosylase II  42.6 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2841  DNA-3-methyladenine glycosylase II  43.2 
 
 
216 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  40.45 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  43.33 
 
 
208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3766  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.18 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  36.7 
 
 
291 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  41.57 
 
 
261 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2864  HhH-GPD  41.27 
 
 
231 aa  138  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2156  DNA-3-methyladenine glycosylase II  42.2 
 
 
208 aa  138  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1486  DNA-3-methyladenine glycosylase II  43.3 
 
 
230 aa  137  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.253605 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1350  HhH-GPD  39.36 
 
 
216 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.12 
 
 
221 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.12 
 
 
312 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.12 
 
 
295 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  38.12 
 
 
312 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  38.12 
 
 
312 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  38.12 
 
 
312 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.12 
 
 
312 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  38.12 
 
 
312 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  44.44 
 
 
209 aa  135  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  39.23 
 
 
223 aa  135  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  36 
 
 
210 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  39.23 
 
 
218 aa  134  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2892  HhH-GPD family protein  39.68 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  hitchhiker  0.00930162 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4930  DNA-3-methyladenine glycosylase II  42.17 
 
 
214 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2569  DNA-3-methyladenine glycosylase protein  42.77 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  46.79 
 
 
163 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  38.67 
 
 
349 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  38.67 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  42.86 
 
 
198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3089  HhH-GPD family protein  41.58 
 
 
217 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  38.12 
 
 
287 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1389  HhH-GPD family protein  37.64 
 
 
340 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.0527923 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.57 
 
 
275 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  40.83 
 
 
199 aa  128  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.57 
 
 
275 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.57 
 
 
275 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  37.57 
 
 
275 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  37.57 
 
 
293 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  40.74 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  39.78 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04389  DNA-3-methyladenine glycosylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06800)  37.79 
 
 
391 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  37.7 
 
 
205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  37.57 
 
 
287 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04456  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.25 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  35.59 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0684  DNA-3-methyladenine glycosidase  40 
 
 
226 aa  125  5e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.59 
 
 
206 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0601  HhH-GPD family protein  40 
 
 
226 aa  124  9e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2090  HhH-GPD family protein  37.02 
 
 
219 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1624  HhH-GPD family protein  38.62 
 
 
219 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  38.25 
 
 
209 aa  123  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0855  HhH-GPD family protein  34.38 
 
 
206 aa  121  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.908552 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  39.6 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3366  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.56 
 
 
221 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  37.85 
 
 
202 aa  118  9e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.18 
 
 
288 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.63 
 
 
288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0291  HhH-GPD family protein  38.25 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000526477  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  36.9 
 
 
196 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0495  HhH-GPD family protein  31.08 
 
 
231 aa  113  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.65814  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3183  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.5 
 
 
225 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0547  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.44 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2508  HhH-GPD family protein  37.13 
 
 
269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.59 
 
 
287 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3255  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.16 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00136627  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1445  HhH-GPD  33.16 
 
 
219 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0863627  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  40.72 
 
 
195 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  37.79 
 
 
232 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2269  HhH-GPD family protein  35.96 
 
 
207 aa  108  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309984  normal  0.119846 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1593  base-excision DNA repair protein  37.21 
 
 
219 aa  105  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2665  HhH-GPD family protein  32.16 
 
 
201 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  35.8 
 
 
217 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  36.99 
 
 
219 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0541  endonuclease III domain protein  30.99 
 
 
287 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  31.67 
 
 
202 aa  102  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  28.42 
 
 
201 aa  101  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  34.83 
 
 
219 aa  101  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2427  HhH-GPD family protein  37.99 
 
 
368 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.610261  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1299  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.86 
 
 
142 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0767189  normal  0.0206516 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46865  predicted protein  34.33 
 
 
394 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259126  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04530  DNA-3-methyladenine glycosidase, putative  41.48 
 
 
461 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  35.33 
 
 
205 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0413  DNA-3-methyladenine glycosylase II, C-terminus  29.82 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0403  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.82 
 
 
287 aa  99.8  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0471  endonuclease III domain protein  29.82 
 
 
287 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  29.82 
 
 
287 aa  98.6  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>