189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46865 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_46865  predicted protein  100 
 
 		 394 aa  816    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259126  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  31.61 
 
 		 218 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  31.25 
 
 		 223 aa  103  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2864  HhH-GPD  30.71 
 
 		 231 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2892  HhH-GPD family protein  30.71 
 
 		 246 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  hitchhiker  0.00930162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  32.47 
 
 		 349 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3089  HhH-GPD family protein  32.81 
 
 		 217 aa  99.4  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  32.64 
 
 		 291 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  34.72 
 
 		 205 aa  97.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1671  HhH-GPD family protein  30.26 
 
 		 216 aa  97.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 219 aa  97.4  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  34.02 
 
 		 234 aa  97.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  31.96 
 
 		 281 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  32.29 
 
 		 261 aa  96.3  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  31.28 
 
 		 208 aa  95.9  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1350  HhH-GPD  32.29 
 
 		 216 aa  95.9  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.72 
 
 		 217 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  31.44 
 
 		 312 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  31.82 
 
 		 287 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2508  HhH-GPD family protein  28.21 
 
 		 269 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1009  HhH-GPD family protein  31.09 
 
 		 290 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.93 
 
 		 312 aa  93.6  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.31 
 
 		 275 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.81 
 
 		 221 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  31.09 
 
 		 290 aa  93.6  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.93 
 
 		 312 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  30.93 
 
 		 312 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  30.93 
 
 		 312 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  31.25 
 
 		 256 aa  93.2  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  30.93 
 
 		 312 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.31 
 
 		 275 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.31 
 
 		 275 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.93 
 
 		 295 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3495  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.26 
 
 		 220 aa  92.8  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2090  HhH-GPD family protein  29.55 
 
 		 219 aa  92.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72517  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  31.31 
 
 		 275 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  31.12 
 
 		 287 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1624  HhH-GPD family protein  29.55 
 
 		 219 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1389  HhH-GPD family protein  31.77 
 
 		 340 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.0527923 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  32.41 
 
 		 207 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  30.32 
 
 		 196 aa  86.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04530  DNA-3-methyladenine glycosidase, putative  34.22 
 
 		 461 aa  86.7  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  29.17 
 
 		 293 aa  86.3  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  28.5 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0291  HhH-GPD family protein  27.98 
 
 		 190 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000526477  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  28.12 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  30.73 
 
 		 195 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.6 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3766  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.19 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.85 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4930  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.91 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04389  DNA-3-methyladenine glycosylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06800)  27.8 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.63 
 
 		 163 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0630  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.17 
 
 		 186 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000706264  normal  0.223656 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.93 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04456  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.65 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  28.19 
 
 		 232 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  28.72 
 
 		 198 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0601  HhH-GPD family protein  27.59 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1593  base-excision DNA repair protein  28.19 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1055  HhH-GPD family protein  28.43 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0684  DNA-3-methyladenine glycosidase  29.06 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2525  HhH-GPD family protein  27.75 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0239966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  26.13 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0790  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.24 
 
 		 220 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0739  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.67 
 
 		 208 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1486  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.7 
 
 		 230 aa  69.3  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.253605 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  28.19 
 
 		 219 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.72 
 
 		 288 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1026  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.78 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2156  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.98 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1477  HhH-GPD family protein  26.6 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2435  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.83 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2569  DNA-3-methyladenine glycosylase protein  26.89 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  25.79 
 
 		 202 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1159  HhH-GPD family protein  26.92 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000451555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2665  HhH-GPD family protein  27.13 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4478  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.27 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.795178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  25.12 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2841  DNA-3-methyladenine glycosylase II  24.8 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  21.61 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0318  HhH-GPD family protein  25.62 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.536275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3847  HhH-GPD family protein  24.38 
 
 		 214 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1134  putative DNA-3-methyladenine glycosidase  26.6 
 
 		 217 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.24 
 
 		 208 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545476  normal  0.965549 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10470  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  25.24 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0738  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.24 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  24.61 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.08 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  26.06 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0747  DNA-3-methyladenine glycosidase II  29.41 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3183  DNA-3-methyladenine glycosylase II  24.27 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0813  HhH-GPD  29.03 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0242454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3554  HhH-GPD family protein  24.62 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0547  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.14 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.84 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1846  HhH-GPD family protein  27.66 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0131  HhH-GPD family protein  25.11 
 
 		 204 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3470  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 523 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884533  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3255  DNA-3-methyladenine glycosylase II  24.63 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00136627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>