275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1846 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1846  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 229 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4878  HhH-GPD family protein  85.45 
 
 		 227 aa  315  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3124  HhH-GPD family protein  65.22 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  51.85 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  51.85 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1593  base-excision DNA repair protein  50.93 
 
 		 219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1134  putative DNA-3-methyladenine glycosidase  50.94 
 
 		 217 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5238  HhH-GPD family protein  49.51 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0747  DNA-3-methyladenine glycosidase II  50 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0813  HhH-GPD  47.57 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0242454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0924  HhH-GPD  48.06 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3487  HhH-GPD  50.49 
 
 		 217 aa  177  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3847  HhH-GPD family protein  47.44 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3554  HhH-GPD family protein  47.2 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4886  HhH-GPD  47.57 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3025  HhH-GPD  46.89 
 
 		 214 aa  168  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.559258  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  48.1 
 
 		 217 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1157  HhH-GPD  46.41 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.018776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2525  HhH-GPD family protein  43.87 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.435858 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  46.67 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2727  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  45.75 
 
 		 209 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1385  HhH-GPD family protein  45.75 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  37.24 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1964  HhH-GPD  42.79 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0340706  normal  0.441447 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2076  HhH-GPD family protein  45.19 
 
 		 209 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180031  normal  0.218221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4002  DNA-3-methyladenine glycosidase II  40.28 
 
 		 217 aa  131  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2427  HhH-GPD family protein  42.58 
 
 		 368 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.610261  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  42.5 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1477  HhH-GPD family protein  32.16 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2665  HhH-GPD family protein  32.64 
 
 		 201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1445  HhH-GPD  35.65 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0863627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  40.74 
 
 		 196 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  39.8 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  38.42 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3945  HhH-GPD family protein  47.6 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0495  HhH-GPD family protein  36 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.65814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  38.42 
 
 		 209 aa  112  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2269  HhH-GPD family protein  34.78 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309984  normal  0.119846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.24 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545476  normal  0.965549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0738  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.73 
 
 		 207 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.32 
 
 		 206 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0381  HhH-GPD family protein  41.41 
 
 		 250 aa  99.4  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0471539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  33.51 
 
 		 205 aa  98.6  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  30.32 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  34.39 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  41.83 
 
 		 163 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10470  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  30.92 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  29.74 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0739  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.87 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2090  HhH-GPD family protein  30.53 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1624  HhH-GPD family protein  31.03 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  28.43 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4478  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.87 
 
 		 208 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.795178 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  33.16 
 
 		 198 aa  91.7  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  30.06 
 
 		 303 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  30.06 
 
 		 303 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  32.02 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  30.06 
 
 		 303 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  30.06 
 
 		 303 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  30.06 
 
 		 303 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  29.89 
 
 		 303 aa  89.4  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  38.19 
 
 		 297 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  37.38 
 
 		 297 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0291  HhH-GPD family protein  34.25 
 
 		 190 aa  88.6  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000526477  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2156  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.5 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.52 
 
 		 288 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0107  HhH-GPD  37.06 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.59 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  30.29 
 
 		 303 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  29.57 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.81 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  28.57 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  31.06 
 
 		 201 aa  86.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.09 
 
 		 288 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  28.3 
 
 		 312 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.3 
 
 		 312 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7756  transcriptional regulator, AraC family  50.37 
 
 		 564 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.3 
 
 		 312 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.3 
 
 		 295 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  28.3 
 
 		 312 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  28.3 
 
 		 312 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  29.19 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.23 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3495  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.87 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  39.51 
 
 		 195 aa  85.5  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  28.3 
 
 		 312 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0044  Ada metal-binding domain-containing protein  38.1 
 
 		 513 aa  85.1  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0684  DNA-3-methyladenine glycosidase  32.99 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0601  HhH-GPD family protein  32.99 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.48 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  29.25 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1486  DNA-3-methyladenine glycosylase II  38.42 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.253605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  29.02 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3766  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.73 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  29.71 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04456  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.66 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3089  HhH-GPD family protein  28.43 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1671  HhH-GPD family protein  31.73 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  36 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2841  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.35 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>