273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2076 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2076  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 209 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180031  normal  0.218221 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1385  HhH-GPD family protein  84.21 
 
 		 209 aa  343  7e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2727  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  83.25 
 
 		 209 aa  337  9e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1157  HhH-GPD  61.17 
 
 		 210 aa  248  6e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.018776 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  60.19 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1964  HhH-GPD  58.16 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0340706  normal  0.441447 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0495  HhH-GPD family protein  46.24 
 
 		 231 aa  171  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.65814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1445  HhH-GPD  41.88 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0863627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3945  HhH-GPD family protein  53.66 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1846  HhH-GPD family protein  45.67 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  45 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1593  base-excision DNA repair protein  45 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  45 
 
 		 232 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  44.13 
 
 		 217 aa  144  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3025  HhH-GPD  43.75 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.559258  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3124  HhH-GPD family protein  45.54 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3554  HhH-GPD family protein  43.78 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4878  HhH-GPD family protein  50.24 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2427  HhH-GPD family protein  45.31 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.610261  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3847  HhH-GPD family protein  42.79 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1134  putative DNA-3-methyladenine glycosidase  41.06 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  41.84 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1477  HhH-GPD family protein  33.67 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5238  HhH-GPD family protein  40.87 
 
 		 239 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  43.3 
 
 		 205 aa  128  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4886  HhH-GPD  40.38 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.09 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0813  HhH-GPD  40.67 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0242454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  37.24 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0924  HhH-GPD  42.35 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0107  HhH-GPD  46.99 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0747  DNA-3-methyladenine glycosidase II  39.15 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3487  HhH-GPD  37.02 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.67 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  33.67 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  39.88 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1486  DNA-3-methyladenine glycosylase II  44.44 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.253605 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2525  HhH-GPD family protein  38.31 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.435858 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  39.18 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.51 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2435  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.91 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  32.62 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  36.96 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2156  DNA-3-methyladenine glycosylase II  38.79 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2569  DNA-3-methyladenine glycosylase protein  40.85 
 
 		 212 aa  101  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10470  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  34.03 
 
 		 234 aa  101  7e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2665  HhH-GPD family protein  28.93 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4930  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.42 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1159  HhH-GPD family protein  37.1 
 
 		 235 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000451555  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  39.49 
 
 		 202 aa  99  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0855  HhH-GPD family protein  34.48 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.908552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3244  HhH-GPD family protein  34.78 
 
 		 198 aa  98.2  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2841  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.8 
 
 		 216 aa  97.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  36.81 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0547  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.8 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1299  DNA-3-methyladenine glycosylase II  42.34 
 
 		 142 aa  95.9  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0767189  normal  0.0206516 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0738  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.13 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  41.18 
 
 		 163 aa  95.9  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4002  DNA-3-methyladenine glycosidase II  38.19 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3183  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.55 
 
 		 225 aa  95.1  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.07 
 
 		 221 aa  94.7  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3766  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.2 
 
 		 218 aa  94.7  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.32 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545476  normal  0.965549 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  35.91 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  33.15 
 
 		 312 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  36.36 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  32.07 
 
 		 312 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.07 
 
 		 312 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3255  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.94 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00136627  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.07 
 
 		 312 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.07 
 
 		 295 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  32.07 
 
 		 312 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  32.07 
 
 		 312 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0790  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.91 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0739  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.14 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.16 
 
 		 217 aa  91.3  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  33.51 
 
 		 281 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  33.51 
 
 		 349 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2387  HhH-GPD family protein  36.51 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1026  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.57 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2016  base excision DNA repair protein  36.51 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2288  base excision DNA repair protein  36.51 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2525  HhH-GPD family protein  30.48 
 
 		 201 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0239966 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  31.84 
 
 		 287 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  34.44 
 
 		 291 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4478  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.5 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.795178 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.28 
 
 		 275 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.28 
 
 		 275 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.28 
 
 		 275 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  31.18 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  30.43 
 
 		 275 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  33.89 
 
 		 290 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  31.85 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.93 
 
 		 301 aa  85.5  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  30.98 
 
 		 293 aa  85.5  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1389  HhH-GPD family protein  31.84 
 
 		 340 aa  84.7  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.0527923 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0684  DNA-3-methyladenine glycosidase  34.43 
 
 		 226 aa  84.7  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  35 
 
 		 195 aa  84.7  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3357  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  40 
 
 		 486 aa  84.7  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>