285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3124 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3124  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 249 aa  487  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1846  HhH-GPD family protein  65.22 
 
 		 229 aa  251  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4878  HhH-GPD family protein  64.59 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1134  putative DNA-3-methyladenine glycosidase  50 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0813  HhH-GPD  48.08 
 
 		 240 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0242454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0924  HhH-GPD  48.17 
 
 		 243 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0747  DNA-3-methyladenine glycosidase II  48.58 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3554  HhH-GPD family protein  49.5 
 
 		 214 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3847  HhH-GPD family protein  49.5 
 
 		 214 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  48.56 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4886  HhH-GPD  50 
 
 		 220 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  53.37 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5238  HhH-GPD family protein  49.52 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  48.08 
 
 		 232 aa  175  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1593  base-excision DNA repair protein  47.12 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3487  HhH-GPD  48.56 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  45.58 
 
 		 210 aa  166  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3025  HhH-GPD  50.26 
 
 		 214 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.559258  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1385  HhH-GPD family protein  46.48 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1157  HhH-GPD  44.65 
 
 		 210 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.018776 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2727  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  46.95 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2525  HhH-GPD family protein  43.56 
 
 		 215 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.435858 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4002  DNA-3-methyladenine glycosidase II  42.44 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1964  HhH-GPD  46.86 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0340706  normal  0.441447 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2076  HhH-GPD family protein  45.54 
 
 		 209 aa  141  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180031  normal  0.218221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  42.63 
 
 		 199 aa  132  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3945  HhH-GPD family protein  50.99 
 
 		 207 aa  132  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0495  HhH-GPD family protein  36.02 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.65814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2427  HhH-GPD family protein  39.8 
 
 		 368 aa  125  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.610261  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  42.08 
 
 		 205 aa  125  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1445  HhH-GPD  33.18 
 
 		 219 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0863627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  40 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  45.39 
 
 		 163 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2665  HhH-GPD family protein  35.29 
 
 		 201 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  37.77 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  39.8 
 
 		 205 aa  122  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  34.34 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1477  HhH-GPD family protein  31.16 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  35.75 
 
 		 206 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.75 
 
 		 206 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  36.73 
 
 		 198 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  37.3 
 
 		 209 aa  111  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0107  HhH-GPD  40.36 
 
 		 216 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  37.3 
 
 		 208 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10470  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  34.18 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0291  HhH-GPD family protein  36.46 
 
 		 190 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000526477  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.51 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  32.98 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  33.51 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.51 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.51 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.51 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  33.51 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  33.51 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  33.51 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  30.69 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  43.33 
 
 		 195 aa  99.8  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  36.46 
 
 		 207 aa  99  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  30.26 
 
 		 210 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  32.45 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  34.81 
 
 		 202 aa  97.4  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  32.98 
 
 		 287 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  32.93 
 
 		 201 aa  96.3  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2269  HhH-GPD family protein  33.86 
 
 		 207 aa  95.9  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309984  normal  0.119846 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.45 
 
 		 275 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1159  HhH-GPD family protein  32.39 
 
 		 235 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000451555  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.45 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.45 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  32.45 
 
 		 275 aa  95.5  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  31.22 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0381  HhH-GPD family protein  36.45 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0471539  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  32.98 
 
 		 349 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  30.69 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.65 
 
 		 208 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545476  normal  0.965549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  32.45 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  31.38 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  32.45 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  33.51 
 
 		 281 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  32.35 
 
 		 303 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  32.35 
 
 		 303 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  32.35 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  32.35 
 
 		 303 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0738  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.98 
 
 		 207 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  32.35 
 
 		 303 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  32.35 
 
 		 303 aa  92.8  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.39 
 
 		 209 aa  92.4  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  32.28 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0739  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.98 
 
 		 208 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1009  HhH-GPD family protein  30.32 
 
 		 290 aa  91.7  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  31.76 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.18 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1671  HhH-GPD family protein  31.91 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1624  HhH-GPD family protein  33.02 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1389  HhH-GPD family protein  31.38 
 
 		 340 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.0527923 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  29.23 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2090  HhH-GPD family protein  32.8 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72517  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  30.32 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.9 
 
 		 288 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0790  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.73 
 
 		 220 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2525  HhH-GPD family protein  28.92 
 
 		 201 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0239966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>