286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4878 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4878  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 227 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1846  HhH-GPD family protein  85.45 
 
 		 229 aa  356  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3124  HhH-GPD family protein  64.59 
 
 		 249 aa  228  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  50.93 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  50.93 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1593  base-excision DNA repair protein  50 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1134  putative DNA-3-methyladenine glycosidase  50 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0747  DNA-3-methyladenine glycosidase II  49.76 
 
 		 217 aa  184  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3487  HhH-GPD  49.77 
 
 		 217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5238  HhH-GPD family protein  49.76 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0813  HhH-GPD  47.62 
 
 		 240 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0242454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0924  HhH-GPD  48.1 
 
 		 243 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3847  HhH-GPD family protein  48.11 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3554  HhH-GPD family protein  47.87 
 
 		 214 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2525  HhH-GPD family protein  45.33 
 
 		 215 aa  175  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.435858 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  48.8 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4886  HhH-GPD  47.62 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1157  HhH-GPD  46.67 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.018776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3025  HhH-GPD  46.45 
 
 		 214 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.559258  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  51.78 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2727  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  48.57 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1385  HhH-GPD family protein  48.57 
 
 		 209 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  38.07 
 
 		 202 aa  142  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2076  HhH-GPD family protein  49.28 
 
 		 209 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180031  normal  0.218221 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1964  HhH-GPD  45.19 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0340706  normal  0.441447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4002  DNA-3-methyladenine glycosidase II  41.35 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1477  HhH-GPD family protein  31.66 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  42.78 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3945  HhH-GPD family protein  47.62 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2665  HhH-GPD family protein  32.64 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  43.07 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2427  HhH-GPD family protein  42.51 
 
 		 368 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.610261  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.47 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  40.1 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  40.39 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0495  HhH-GPD family protein  36.63 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.65814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1445  HhH-GPD  35.07 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0863627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  35.64 
 
 		 205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2269  HhH-GPD family protein  34.69 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309984  normal  0.119846 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  38.38 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  43.42 
 
 		 163 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0291  HhH-GPD family protein  37.57 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000526477  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2090  HhH-GPD family protein  32.72 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.76 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545476  normal  0.965549 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1624  HhH-GPD family protein  33.51 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  32.78 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  30.77 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0738  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.69 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  30.39 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.22 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0739  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.24 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  35.14 
 
 		 208 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  30.92 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.41 
 
 		 288 aa  98.2  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  34.39 
 
 		 219 aa  98.2  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1486  DNA-3-methyladenine glycosylase II  41.67 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.253605 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.22 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0381  HhH-GPD family protein  41.33 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0471539  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  31.38 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.1 
 
 		 251 aa  96.3  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0107  HhH-GPD  38.92 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2841  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.96 
 
 		 216 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0601  HhH-GPD family protein  34.31 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2435  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.96 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  30 
 
 		 201 aa  95.1  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3089  HhH-GPD family protein  32.28 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4478  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.71 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.795178 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0684  DNA-3-methyladenine glycosidase  33.82 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10470  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  34.12 
 
 		 234 aa  92.8  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2156  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.91 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2864  HhH-GPD  31.35 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  28.64 
 
 		 312 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.64 
 
 		 312 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  28.64 
 
 		 312 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  28.64 
 
 		 312 aa  91.7  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.64 
 
 		 295 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.64 
 
 		 312 aa  91.7  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2569  DNA-3-methyladenine glycosylase protein  35.29 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3495  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.46 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482188 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1159  HhH-GPD family protein  31.63 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000451555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  38.58 
 
 		 297 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  37.85 
 
 		 297 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  38.89 
 
 		 195 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0188  HhH-GPD family protein  35.62 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.536276 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0044  Ada metal-binding domain-containing protein  40.48 
 
 		 513 aa  90.1  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1671  HhH-GPD family protein  32.62 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  28.64 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.64 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  37.33 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2892  HhH-GPD family protein  31.35 
 
 		 246 aa  89.4  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  hitchhiker  0.00930162 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  30.11 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.33 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  32.83 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0131  HhH-GPD family protein  35.16 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121534 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.87 
 
 		 288 aa  89  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.32 
 
 		 303 aa  88.6  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.32 
 
 		 303 aa  88.6  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.32 
 
 		 303 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7756  transcriptional regulator, AraC family  48 
 
 		 564 aa  88.6  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1350  HhH-GPD  30.11 
 
 		 216 aa  88.2  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>