280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3025 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3025  HhH-GPD  100 
 
 		 214 aa  414  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.559258  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  63.21 
 
 		 232 aa  259  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  63.21 
 
 		 219 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1593  base-excision DNA repair protein  62.26 
 
 		 219 aa  254  5e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3847  HhH-GPD family protein  52.48 
 
 		 214 aa  197  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3554  HhH-GPD family protein  52.97 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2525  HhH-GPD family protein  52.17 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.435858 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4002  DNA-3-methyladenine glycosidase II  46.23 
 
 		 217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1846  HhH-GPD family protein  46.89 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0813  HhH-GPD  44.12 
 
 		 240 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0242454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0924  HhH-GPD  43.96 
 
 		 243 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5238  HhH-GPD family protein  44.17 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  47.78 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0747  DNA-3-methyladenine glycosidase II  43.96 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4886  HhH-GPD  44.44 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1134  putative DNA-3-methyladenine glycosidase  45.08 
 
 		 217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3124  HhH-GPD family protein  50.26 
 
 		 249 aa  148  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3487  HhH-GPD  41.83 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4878  HhH-GPD family protein  46.45 
 
 		 227 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2727  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  42.5 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1157  HhH-GPD  44.22 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.018776 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1385  HhH-GPD family protein  44.39 
 
 		 209 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  36.92 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  39.32 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1964  HhH-GPD  42.86 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0340706  normal  0.441447 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0495  HhH-GPD family protein  34.43 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.65814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2076  HhH-GPD family protein  42.31 
 
 		 209 aa  124  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180031  normal  0.218221 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1445  HhH-GPD  31.46 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0863627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2665  HhH-GPD family protein  33.93 
 
 		 201 aa  111  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  37.44 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  40 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2427  HhH-GPD family protein  36.82 
 
 		 368 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.610261  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1477  HhH-GPD family protein  32.39 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3945  HhH-GPD family protein  38.97 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  36.21 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.74 
 
 		 199 aa  101  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  34.09 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  37.42 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  34.16 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  33.54 
 
 		 196 aa  96.3  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0107  HhH-GPD  36.69 
 
 		 216 aa  94  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  33.95 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.33 
 
 		 163 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  31.48 
 
 		 291 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1009  HhH-GPD family protein  30.43 
 
 		 290 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  29.73 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3495  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.91 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482188 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  30.86 
 
 		 290 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.42 
 
 		 221 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.42 
 
 		 295 aa  85.1  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  28.42 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  28.42 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.42 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  28.42 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  28.42 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  38.89 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.42 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  33.13 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  30.51 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  28.66 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.66 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  26.98 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2269  HhH-GPD family protein  31.93 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309984  normal  0.119846 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  30.51 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  30.49 
 
 		 287 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2419  AlkA domain protein  38.01 
 
 		 302 aa  82  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.839778  hitchhiker  0.00593166 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.88 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.88 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.88 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4930  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.77 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  29.88 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.49 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3244  HhH-GPD family protein  25.4 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  29.88 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4133  transcriptional regulator, AraC family  45.87 
 
 		 484 aa  79  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1055  HhH-GPD family protein  31.87 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  30.46 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  29.63 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0291  HhH-GPD family protein  29.55 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000526477  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0381  HhH-GPD family protein  36.67 
 
 		 250 aa  78.2  0.00000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0471539  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  30.06 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  29.27 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0630  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.88 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000706264  normal  0.223656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0948  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  32.08 
 
 		 477 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1389  HhH-GPD family protein  28.42 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.0527923 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5315  transcriptional regulator Ada  33.33 
 
 		 509 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3766  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.89 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.71 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  26.26 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0044  Ada metal-binding domain-containing protein  33.72 
 
 		 513 aa  74.7  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  32.8 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.95 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  36.05 
 
 		 297 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  35.05 
 
 		 297 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1671  HhH-GPD family protein  28.88 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.16 
 
 		 251 aa  71.2  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1072  transcriptional regulator, AraC family  42.74 
 
 		 527 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2090  HhH-GPD family protein  31.49 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1624  HhH-GPD family protein  31.49 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.78 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>