253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1964 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1964  HhH-GPD  100 
 
 		 225 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0340706  normal  0.441447 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  63.86 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1157  HhH-GPD  60.89 
 
 		 210 aa  225  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.018776 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1385  HhH-GPD family protein  56.5 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2727  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  56.5 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2076  HhH-GPD family protein  58.16 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180031  normal  0.218221 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3945  HhH-GPD family protein  54.95 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0495  HhH-GPD family protein  42.13 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.65814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3554  HhH-GPD family protein  44.17 
 
 		 214 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1445  HhH-GPD  40.89 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0863627  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  46.41 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1593  base-excision DNA repair protein  45.93 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  47.14 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3847  HhH-GPD family protein  41.75 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  45.23 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1846  HhH-GPD family protein  44.02 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3124  HhH-GPD family protein  46.92 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1134  putative DNA-3-methyladenine glycosidase  42.71 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4886  HhH-GPD  41.98 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0924  HhH-GPD  40.28 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3025  HhH-GPD  42.86 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.559258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2427  HhH-GPD family protein  45.05 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.610261  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5238  HhH-GPD family protein  40.28 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0747  DNA-3-methyladenine glycosidase II  40.57 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4002  DNA-3-methyladenine glycosidase II  42.11 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  42.57 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2525  HhH-GPD family protein  42.31 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.435858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0813  HhH-GPD  39.34 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0242454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3487  HhH-GPD  38.68 
 
 		 217 aa  125  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  43 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4878  HhH-GPD family protein  44.98 
 
 		 227 aa  121  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  42.6 
 
 		 199 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1477  HhH-GPD family protein  33.67 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0107  HhH-GPD  39.76 
 
 		 216 aa  106  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  37.36 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  39.75 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  39.26 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  38.1 
 
 		 202 aa  99.4  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  39.08 
 
 		 198 aa  95.1  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  34.94 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2665  HhH-GPD family protein  31.22 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.44 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  34.16 
 
 		 206 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  37.95 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  33.15 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  34.44 
 
 		 312 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.54 
 
 		 206 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.44 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1159  HhH-GPD family protein  38.17 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000451555  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.44 
 
 		 312 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.44 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  34.44 
 
 		 312 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  34.44 
 
 		 312 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  34.44 
 
 		 312 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  32.6 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.95 
 
 		 217 aa  88.2  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  33.7 
 
 		 349 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10470  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  33.95 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  33.7 
 
 		 281 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1486  DNA-3-methyladenine glycosylase II  38.2 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.253605 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.31 
 
 		 163 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  33.94 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2525  HhH-GPD family protein  31.9 
 
 		 201 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0239966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3244  HhH-GPD family protein  32.3 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  28.49 
 
 		 201 aa  86.3  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  33.73 
 
 		 207 aa  85.9  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3183  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.34 
 
 		 225 aa  85.1  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  34.44 
 
 		 291 aa  85.1  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2269  HhH-GPD family protein  32.16 
 
 		 207 aa  85.1  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309984  normal  0.119846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1671  HhH-GPD family protein  30.43 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3366  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  36.25 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  33.7 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  33.89 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1009  HhH-GPD family protein  34.07 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.15 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.15 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.15 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  33.15 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1389  HhH-GPD family protein  32.07 
 
 		 340 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.0527923 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  33.15 
 
 		 275 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.03 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0738  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.34 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0547  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.68 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  33.15 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.35 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.61 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.36 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.68 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545476  normal  0.965549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  32.65 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  32.49 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0855  HhH-GPD family protein  29.44 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.908552 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  33.72 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2569  DNA-3-methyladenine glycosylase protein  31.29 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3495  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.82 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482188 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2435  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.86 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0601  HhH-GPD family protein  31.16 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0684  DNA-3-methyladenine glycosidase  31.66 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2892  HhH-GPD family protein  30.53 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  hitchhiker  0.00930162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>