280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0381 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0381  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 250 aa  482  1e-135  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0471539  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1846  HhH-GPD family protein  43.37 
 
 		 229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  44.3 
 
 		 163 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  41.42 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1134  putative DNA-3-methyladenine glycosidase  35.78 
 
 		 217 aa  99  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  40.24 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5238  HhH-GPD family protein  35.96 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4878  HhH-GPD family protein  40.51 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1593  base-excision DNA repair protein  39.64 
 
 		 219 aa  96.3  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0813  HhH-GPD  36.68 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0242454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0924  HhH-GPD  37.69 
 
 		 243 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3025  HhH-GPD  39.44 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.559258  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1477  HhH-GPD family protein  25.5 
 
 		 199 aa  94  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2427  HhH-GPD family protein  36.79 
 
 		 368 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.610261  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0747  DNA-3-methyladenine glycosidase II  37.99 
 
 		 217 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10470  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  29.86 
 
 		 234 aa  92.8  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3847  HhH-GPD family protein  38.2 
 
 		 214 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3554  HhH-GPD family protein  37.99 
 
 		 214 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2269  HhH-GPD family protein  30.69 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309984  normal  0.119846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4886  HhH-GPD  36.41 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3487  HhH-GPD  36.1 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  34.71 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3124  HhH-GPD family protein  38.35 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.04 
 
 		 251 aa  88.6  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  37.78 
 
 		 217 aa  88.6  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0630  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.58 
 
 		 186 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000706264  normal  0.223656 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  29.56 
 
 		 201 aa  86.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  30.34 
 
 		 202 aa  86.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0107  HhH-GPD  34.39 
 
 		 216 aa  85.5  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  30.46 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2773  transcriptional regulator, AraC family  35.33 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  30 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2665  HhH-GPD family protein  25.5 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1012  transcriptional regulator, AraC family  42.94 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.84 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  32.02 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2525  HhH-GPD family protein  39.33 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.435858 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  28.36 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  29.95 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  29.95 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  29.95 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.1 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.95 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.1 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  33.01 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  28.22 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.22 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2505  putative transcription regulator protein  35.33 
 
 		 490 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0201165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3301  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  38.67 
 
 		 494 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0977453  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0323  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.64 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246796  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  34.62 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.83 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3495  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.4 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482188 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.61 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.61 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.61 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0495  HhH-GPD family protein  31.88 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.65814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2525  HhH-GPD family protein  28.48 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0239966 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0684  DNA-3-methyladenine glycosidase  34.19 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  30.61 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0133  DNA-3-methyladenine glycosylase 2  35.15 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.221432  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  28.22 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1385  HhH-GPD family protein  35.78 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  33.5 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0044  Ada metal-binding domain-containing protein  35.08 
 
 		 513 aa  78.6  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  30.1 
 
 		 275 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3244  HhH-GPD family protein  30.1 
 
 		 198 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  33.95 
 
 		 195 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0116  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.15 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00108548  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2727  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  36.27 
 
 		 209 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2324  DNA-3-methyladenine glycosylase 2  35.15 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04456  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.71 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2301  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.15 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124738  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2835  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.15 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000406051  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2250  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.15 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00101826  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0601  HhH-GPD family protein  34.19 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  29.95 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2369  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 491 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  30.46 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  32.02 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  32.99 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  30.46 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  31.84 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0117  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.65 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000127704  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1157  HhH-GPD  35.67 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.018776 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  30.1 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2864  HhH-GPD  28.86 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1055  HhH-GPD family protein  31.4 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5315  transcriptional regulator Ada  38.5 
 
 		 509 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0086  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.11 
 
 		 343 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00010571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.58 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4002  DNA-3-methyladenine glycosidase II  35.71 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  35.26 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  28 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  24.86 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1445  HhH-GPD  29.84 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0863627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  28.86 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.86 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04530  DNA-3-methyladenine glycosidase, putative  29.61 
 
 		 461 aa  72.4  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  28.43 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>