175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0131 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0131  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 204 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0188  HhH-GPD family protein  97.55 
 
 		 204 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.536276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0220  HhH-GPD family protein  87.75 
 
 		 204 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1366  HhH-GPD family protein  68.66 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1055  HhH-GPD family protein  41.41 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.59 
 
 		 251 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.89 
 
 		 163 aa  85.1  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  36.93 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  34.05 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1486  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.33 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.253605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4878  HhH-GPD family protein  34.7 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  35 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  32.52 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.06 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  30.06 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0855  HhH-GPD family protein  27.01 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.908552 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  33.54 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  31.75 
 
 		 291 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  35.48 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  32.28 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  32.28 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.98 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1846  HhH-GPD family protein  31.94 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  36.02 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  30.82 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1593  base-excision DNA repair protein  35.48 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2156  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.6 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  30.16 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  32.52 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  30.41 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  30.89 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  32.32 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  30.06 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1350  HhH-GPD  33.13 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1009  HhH-GPD family protein  29.63 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1477  HhH-GPD family protein  29.49 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.55 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0601  HhH-GPD family protein  34.81 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.49 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545476  normal  0.965549 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  32.32 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  30.32 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.32 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2864  HhH-GPD  32.52 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.32 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.32 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  30.85 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  30.32 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  30.32 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0738  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.56 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0684  DNA-3-methyladenine glycosidase  34.18 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0739  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.56 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  30.22 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04456  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.08 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1389  HhH-GPD family protein  30.53 
 
 		 340 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.0527923 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1026  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.87 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0790  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.81 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  30.63 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3025  HhH-GPD  32.87 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.559258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  33.54 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0107  HhH-GPD  34.18 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3124  HhH-GPD family protein  33.99 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2892  HhH-GPD family protein  32.7 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  hitchhiker  0.00930162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3495  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.05 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3183  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.6 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.96 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.96 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2269  HhH-GPD family protein  29.84 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309984  normal  0.119846 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.96 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3089  HhH-GPD family protein  31.29 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  36.02 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 287 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2727  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  32.95 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4930  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.17 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1671  HhH-GPD family protein  31.14 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2665  HhH-GPD family protein  26.67 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2569  DNA-3-methyladenine glycosylase protein  30.56 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1159  HhH-GPD family protein  32.61 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000451555  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  33.33 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  31.06 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3255  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.27 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00136627  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3766  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.59 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4478  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.15 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.795178 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1385  HhH-GPD family protein  32.37 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  31.43 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2435  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.41 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  30.9 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  32.7 
 
 		 287 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.83 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2841  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.04 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1157  HhH-GPD  30.57 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.018776 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2090  HhH-GPD family protein  29.45 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1624  HhH-GPD family protein  29.45 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2427  HhH-GPD family protein  27.61 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.610261  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3244  HhH-GPD family protein  29.12 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0630  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.12 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000706264  normal  0.223656 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46865  predicted protein  25.11 
 
 		 394 aa  58.9  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259126  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0747  DNA-3-methyladenine glycosidase II  32.7 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3554  HhH-GPD family protein  33.52 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  33.7 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0495  HhH-GPD family protein  32.93 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.65814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>