175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0220 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0220  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 204 aa  401  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0131  HhH-GPD family protein  87.75 
 
 		 204 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0188  HhH-GPD family protein  87.25 
 
 		 204 aa  352  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.536276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1366  HhH-GPD family protein  69.65 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1055  HhH-GPD family protein  40.91 
 
 		 202 aa  128  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.13 
 
 		 163 aa  85.9  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  34.81 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  32.83 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  37.71 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.18 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1486  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.97 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.253605 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1593  base-excision DNA repair protein  37.14 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  32.28 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  32.92 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.81 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  29.81 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  34.16 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.78 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  37.57 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  35.4 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  37.09 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2156  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.04 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  32.3 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  32.45 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  33.54 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  34.12 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2864  HhH-GPD  34.16 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  32.92 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0601  HhH-GPD family protein  34.81 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0684  DNA-3-methyladenine glycosidase  34.81 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0855  HhH-GPD family protein  26.29 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.908552 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.12 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  31.45 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4878  HhH-GPD family protein  37.5 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  35.4 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1009  HhH-GPD family protein  30.16 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.5 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.5 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  32.5 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  32.5 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1846  HhH-GPD family protein  33.53 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  32.5 
 
 		 312 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.5 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  31.36 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04456  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.96 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1159  HhH-GPD family protein  34.81 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000451555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  32.5 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  32.14 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1350  HhH-GPD  32.92 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2569  DNA-3-methyladenine glycosylase protein  32.22 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  32.73 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3025  HhH-GPD  34.4 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.559258  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3183  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.15 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2727  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  35.71 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1671  HhH-GPD family protein  32.75 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  31.25 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  32.3 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1477  HhH-GPD family protein  27.37 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3124  HhH-GPD family protein  34.64 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2892  HhH-GPD family protein  33.76 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  hitchhiker  0.00930162 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1389  HhH-GPD family protein  31.71 
 
 		 340 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.0527923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0738  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.56 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0790  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.27 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.56 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545476  normal  0.965549 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3089  HhH-GPD family protein  32.14 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3244  HhH-GPD family protein  28.5 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2435  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.92 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.7 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.7 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.7 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1026  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.65 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  32.7 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0739  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.25 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  31.36 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1385  HhH-GPD family protein  35.06 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0107  HhH-GPD  35.44 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2841  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.92 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.25 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2269  HhH-GPD family protein  30.67 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309984  normal  0.119846 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  32.08 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3255  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.47 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00136627  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  32.08 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3766  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.15 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  31.65 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1157  HhH-GPD  31.25 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.018776 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3495  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.62 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2427  HhH-GPD family protein  28 
 
 		 368 aa  62.4  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.610261  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  29.52 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  31.45 
 
 		 287 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2665  HhH-GPD family protein  24.67 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2525  HhH-GPD family protein  26.8 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0239966 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  36.47 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4930  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.12 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1964  HhH-GPD  32.7 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0340706  normal  0.441447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  31.48 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0747  DNA-3-methyladenine glycosidase II  34.29 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0291  HhH-GPD family protein  32.2 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000526477  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0697  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 540 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1134  putative DNA-3-methyladenine glycosidase  33.54 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>