More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3774 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  100 
 
 
303 aa  634    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  92.08 
 
 
303 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  92.08 
 
 
303 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  91.75 
 
 
303 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  91.09 
 
 
303 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  91.09 
 
 
303 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  91.09 
 
 
303 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  88.12 
 
 
303 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  88.45 
 
 
303 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  81.52 
 
 
303 aa  527  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2923  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  39.37 
 
 
302 aa  226  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  41.16 
 
 
300 aa  225  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0318  HhH-GPD family protein  40.54 
 
 
301 aa  218  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.536275 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.64 
 
 
288 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.44 
 
 
288 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.12 
 
 
301 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3755  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 
489 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3470  AraC family transcriptional regulator  34.76 
 
 
523 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884533  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  28.47 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0044  Ada metal-binding domain-containing protein  29.55 
 
 
513 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3357  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  27.24 
 
 
486 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4053  HhH-GPD family protein  28.08 
 
 
330 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1638  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.03 
 
 
504 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1101  Ada metal-binding domain-containing protein  33.78 
 
 
511 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12283  normal  0.610277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0948  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  30.56 
 
 
477 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511809  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3170  alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 
319 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000626479  decreased coverage  0.000000129498 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.84 
 
 
287 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2823  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  34.07 
 
 
534 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379129  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4073  AraC family transcriptional regulator  29.19 
 
 
505 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3087  alcohol dehydrogenase  25.17 
 
 
307 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00020691  hitchhiker  0.00000000000128814 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3954  AlkA domain protein  27.8 
 
 
305 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0202431  normal  0.626285 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6507  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.69 
 
 
319 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000337261  normal  0.0896284 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  33.17 
 
 
287 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  32.84 
 
 
205 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2538  AlkA-like  25.96 
 
 
319 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000684088  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3151  alcohol dehydrogenase  25.96 
 
 
319 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000306407  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3301  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  32.13 
 
 
494 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0977453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0541  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  32.98 
 
 
287 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256846  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1829  transcriptional regulator, AraC family  32.57 
 
 
517 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.719428  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1107  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 
502 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0739915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2913  alcohol dehydrogenase  25.33 
 
 
308 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.304572 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2024  alcohol dehydrogenase  27.52 
 
 
297 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0541  endonuclease III domain protein  32.8 
 
 
287 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  30.99 
 
 
218 aa  102  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04780  DNA methylation and regulatory protein  30.09 
 
 
487 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4833  endonuclease III domain protein  32.37 
 
 
287 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00136763  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3204  alcohol dehydrogenase  24.92 
 
 
324 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0399  DNA-3-methyladenine glycosylase II (3-methyladenine-DNA glycosidase)  31.21 
 
 
287 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0086  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.95 
 
 
343 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00010571  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3144  alcohol dehydrogenase  25 
 
 
323 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000700738  unclonable  0.00000000000553722 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0413  DNA-3-methyladenine glycosylase II, C-terminus  31.43 
 
 
213 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0403  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.79 
 
 
287 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0471  endonuclease III domain protein  31.79 
 
 
287 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2020  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  32.57 
 
 
517 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.416366  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2560  Ada metal-binding domain-containing protein  30.83 
 
 
581 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0490  endonuclease III domain protein  32.95 
 
 
287 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0117  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.48 
 
 
313 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000127704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0323  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.48 
 
 
343 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246796  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2799  transcriptional regulator, Ada family/DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.25 
 
 
496 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  32.16 
 
 
261 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3726  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 
534 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2423  transcriptional regulator, AraC family  30.25 
 
 
496 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245966 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0133  DNA-3-methyladenine glycosylase 2  30 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.221432  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  30.19 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3088  alcohol dehydrogenase  24.32 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000614886  hitchhiker  0.000862712 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0116  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00108548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2301  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30 
 
 
313 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124738  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2324  DNA-3-methyladenine glycosylase 2  30 
 
 
313 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122389  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3037  AlkA domain protein  31.25 
 
 
376 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0138739  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2835  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30 
 
 
304 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000406051  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2250  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30 
 
 
313 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00101826  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3139  AlkA domain protein  28.22 
 
 
308 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  32.16 
 
 
291 aa  96.7  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2950  HhH-GPD family protein  29.1 
 
 
300 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296829  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  31.51 
 
 
297 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06530  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  25.28 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.937537 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1219  transcriptional regulator, AraC family  25.25 
 
 
492 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.627471  normal  0.0317838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3547  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 
512 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  31.66 
 
 
290 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  28.63 
 
 
297 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2326  alcohol dehydrogenase  26.49 
 
 
503 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  31.16 
 
 
256 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2508  HhH-GPD family protein  29.7 
 
 
269 aa  92.4  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1350  HhH-GPD  32.84 
 
 
216 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  30.15 
 
 
349 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  30.15 
 
 
281 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  31.43 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1846  HhH-GPD family protein  30.06 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1009  HhH-GPD family protein  31.16 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.65 
 
 
221 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  29.41 
 
 
234 aa  89.7  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3856  DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  25.75 
 
 
496 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26438  hitchhiker  0.00733732 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  29.15 
 
 
275 aa  89  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1389  HhH-GPD family protein  31.03 
 
 
340 aa  89  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.0527923 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.15 
 
 
275 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3089  HhH-GPD family protein  28.71 
 
 
217 aa  89  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.15 
 
 
275 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.15 
 
 
275 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  29.15 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  29.65 
 
 
312 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>