262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2016 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2387  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 203 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2016  base excision DNA repair protein  100 
 
 		 203 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2288  base excision DNA repair protein  100 
 
 		 203 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3244  HhH-GPD family protein  60.91 
 
 		 198 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  53.06 
 
 		 201 aa  236  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1159  HhH-GPD family protein  50.51 
 
 		 235 aa  215  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000451555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2525  HhH-GPD family protein  53.85 
 
 		 201 aa  207  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0239966 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  48.47 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10470  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  46 
 
 		 234 aa  201  4e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  36.56 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.54 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  34.22 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0107  HhH-GPD  36.31 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.41 
 
 		 221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  32.46 
 
 		 290 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  31.41 
 
 		 312 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.41 
 
 		 312 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1009  HhH-GPD family protein  32.46 
 
 		 290 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.41 
 
 		 312 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.41 
 
 		 295 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  31.41 
 
 		 312 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  31.41 
 
 		 312 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.94 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  36.94 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  31.41 
 
 		 312 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  32.46 
 
 		 291 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  34.44 
 
 		 202 aa  105  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0790  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.63 
 
 		 220 aa  104  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  32.98 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3089  HhH-GPD family protein  32.46 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  38.71 
 
 		 163 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1026  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.63 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  32.46 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  30.37 
 
 		 349 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  29.84 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2892  HhH-GPD family protein  32.84 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  hitchhiker  0.00930162 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  36.61 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1350  HhH-GPD  31.41 
 
 		 216 aa  101  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.65 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  35.14 
 
 		 198 aa  101  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  31.77 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  31.94 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  34.94 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.84 
 
 		 275 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.84 
 
 		 275 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0855  HhH-GPD family protein  32 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.908552 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  29.84 
 
 		 275 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2864  HhH-GPD  31.41 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.84 
 
 		 275 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  29.84 
 
 		 293 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  29.84 
 
 		 287 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  35.33 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  31.94 
 
 		 234 aa  98.6  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  32.29 
 
 		 218 aa  98.2  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  32.43 
 
 		 202 aa  97.8  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3183  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.68 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  29.32 
 
 		 287 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  32.09 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3255  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.82 
 
 		 224 aa  95.5  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00136627  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1671  HhH-GPD family protein  29.23 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1389  HhH-GPD family protein  28.27 
 
 		 340 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.0527923 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  32.35 
 
 		 287 aa  95.1  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0495  HhH-GPD family protein  32.11 
 
 		 231 aa  94.7  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.65814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04456  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.35 
 
 		 224 aa  94  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0399  DNA-3-methyladenine glycosylase II (3-methyladenine-DNA glycosidase)  31.18 
 
 		 287 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2269  HhH-GPD family protein  34.34 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309984  normal  0.119846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0541  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  31.76 
 
 		 287 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0541  endonuclease III domain protein  31.18 
 
 		 287 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4833  endonuclease III domain protein  30.59 
 
 		 287 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1385  HhH-GPD family protein  35.4 
 
 		 209 aa  91.3  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0490  endonuclease III domain protein  30 
 
 		 287 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0291  HhH-GPD family protein  30.11 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000526477  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1624  HhH-GPD family protein  28.12 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 195 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0413  DNA-3-methyladenine glycosylase II, C-terminus  30.59 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2727  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  34.78 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1157  HhH-GPD  31.38 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.018776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  29.32 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0403  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.59 
 
 		 287 aa  89.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2665  HhH-GPD family protein  25.64 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.19 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0471  endonuclease III domain protein  30.59 
 
 		 287 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2090  HhH-GPD family protein  27.6 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30 
 
 		 287 aa  89  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2508  HhH-GPD family protein  30.37 
 
 		 269 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1477  HhH-GPD family protein  27.03 
 
 		 199 aa  88.6  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0630  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.33 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000706264  normal  0.223656 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2076  HhH-GPD family protein  35.98 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180031  normal  0.218221 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2435  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.02 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  28.8 
 
 		 309 aa  87.8  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1486  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.86 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.253605 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.26 
 
 		 209 aa  87  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2841  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.02 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2156  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.74 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  35.26 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3766  DNA-3-methyladenine glycosylase  31 
 
 		 218 aa  84.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2569  DNA-3-methyladenine glycosylase protein  32.43 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04530  DNA-3-methyladenine glycosidase, putative  31.52 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4930  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.74 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>