140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0595 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0595  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  100 
 
 		 300 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2950  HhH-GPD family protein  43.46 
 
 		 300 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296829  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28630  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  37.17 
 
 		 324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.387023  normal  0.162457 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.44 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1848  base excision repair protein, HhH-GPD family  27.87 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1527  HhH-GPD family protein  27.87 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0472301  normal  0.34415 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1452  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 503 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  26.98 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3755  AraC family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051726  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  26.89 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6507  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.46 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000337261  normal  0.0896284 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  24.67 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  24.31 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  24.31 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  24.31 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2538  AlkA-like  27.37 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000684088  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0381  HhH-GPD family protein  32.35 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0471539  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3151  alcohol dehydrogenase  27.37 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000306407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  24.31 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3170  alcohol dehydrogenase  27.37 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000626479  decreased coverage  0.000000129498 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.62 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0044  Ada metal-binding domain-containing protein  26.49 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  28.43 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  22.91 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  22.44 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  29.77 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  27.45 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  28.43 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  28.43 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.45 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  27.45 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.45 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  27.45 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.45 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  28.43 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1389  HhH-GPD family protein  25.98 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.0527923 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3087  alcohol dehydrogenase  24.04 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00020691  hitchhiker  0.00000000000128814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3301  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  32.24 
 
 		 494 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0977453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.03 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.45 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2531  Ada, metal-binding  26.64 
 
 		 545 aa  53.9  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.645313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.45 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1888  alcohol dehydrogenase  24.16 
 
 		 292 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753852  normal  0.559526 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3255  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.27 
 
 		 224 aa  53.5  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00136627  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  27.45 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.45 
 
 		 312 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  27.45 
 
 		 312 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  27.45 
 
 		 312 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.45 
 
 		 312 aa  53.1  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3357  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  29.78 
 
 		 486 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  21.48 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3204  alcohol dehydrogenase  27.36 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1107  AraC family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 502 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0739915 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3954  AlkA domain protein  24.91 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0202431  normal  0.626285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1846  HhH-GPD family protein  29.26 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  21.65 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.45 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2800  alcohol dehydrogenase  27.48 
 
 		 565 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2497  alcohol dehydrogenase  27.23 
 
 		 563 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  28.48 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1624  HhH-GPD family protein  24.36 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  22.88 
 
 		 218 aa  50.8  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2163  HhH-GPD family protein  27.37 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2913  alcohol dehydrogenase  25.38 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.304572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2545  alcohol dehydrogenase  26.34 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2090  HhH-GPD family protein  24.36 
 
 		 219 aa  50.4  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72517  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  27.2 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1458  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 504 aa  50.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  23.73 
 
 		 223 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4133  transcriptional regulator, AraC family  27.03 
 
 		 484 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2820  alcohol dehydrogenase  27.48 
 
 		 565 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1009  HhH-GPD family protein  26.5 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  27.48 
 
 		 217 aa  49.3  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2940  AraC family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 565 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.91789  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1743  AraC family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 501 aa  49.7  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.32779 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  26.98 
 
 		 198 aa  49.3  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3089  HhH-GPD family protein  24.82 
 
 		 217 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  26.47 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  26.09 
 
 		 196 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3554  HhH-GPD family protein  28.43 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2904  AraC family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 502 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.190431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  25.49 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  25.48 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3766  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.75 
 
 		 218 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1557  transcriptional regulator, AraC family  26.34 
 
 		 565 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.486878  hitchhiker  0.00513105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  21.98 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3144  alcohol dehydrogenase  25.31 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000700738  unclonable  0.00000000000553722 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3088  alcohol dehydrogenase  28 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000614886  hitchhiker  0.000862712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3139  AlkA domain protein  26.02 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.88 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  19.7 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1671  HhH-GPD family protein  24.51 
 
 		 216 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2841  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.27 
 
 		 216 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3847  HhH-GPD family protein  28.57 
 
 		 214 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2435  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.46 
 
 		 216 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0630  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.32 
 
 		 186 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000706264  normal  0.223656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4073  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 505 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  26.85 
 
 		 202 aa  46.6  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  28.89 
 
 		 256 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0739  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.5 
 
 		 208 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>