90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0653 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  55.87 
 
 
286 aa  311  7.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  53.87 
 
 
285 aa  298  7e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  48.2 
 
 
299 aa  262  4e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  43.43 
 
 
283 aa  226  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  40.14 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  40.74 
 
 
279 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  34.05 
 
 
297 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  28.57 
 
 
287 aa  171  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  34.78 
 
 
295 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  33.46 
 
 
295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  36.91 
 
 
307 aa  159  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  34.69 
 
 
284 aa  158  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  30.17 
 
 
312 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  29.83 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  33.45 
 
 
306 aa  145  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  33.7 
 
 
300 aa  145  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.32 
 
 
334 aa  145  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  33.67 
 
 
309 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  33.88 
 
 
308 aa  142  9e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.94 
 
 
293 aa  139  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  29.74 
 
 
336 aa  137  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  31.91 
 
 
272 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  35.69 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  29.21 
 
 
414 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30.72 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  28.71 
 
 
311 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.78 
 
 
312 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.38 
 
 
313 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  25.57 
 
 
312 aa  105  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.27 
 
 
312 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  26.93 
 
 
410 aa  92.8  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  29.13 
 
 
245 aa  90.1  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  26.81 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.79 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  35.66 
 
 
269 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.14 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.89 
 
 
303 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  30.3 
 
 
278 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.89 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.89 
 
 
303 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.89 
 
 
303 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.89 
 
 
303 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.45 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.45 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.64 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06530  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  30.98 
 
 
286 aa  55.8  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.937537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2419  AlkA domain protein  29.48 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.839778  hitchhiker  0.00593166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  28.74 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1250  hypothetical protein  25.33 
 
 
298 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.858422 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  24.03 
 
 
309 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  24.71 
 
 
288 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  25 
 
 
303 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  24 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  25 
 
 
303 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  23.56 
 
 
220 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3870  DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  26.06 
 
 
517 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3944  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  26.06 
 
 
517 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445653  hitchhiker  0.00805865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0595  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  27.2 
 
 
300 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  30.77 
 
 
297 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4322  alcohol dehydrogenase  24.55 
 
 
495 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3301  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  26.82 
 
 
494 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0977453  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11344  Ada regulatory protein alkA  25.81 
 
 
496 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.334528  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0318  HhH-GPD family protein  28.4 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.536275 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3856  DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  26.74 
 
 
496 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26438  hitchhiker  0.00733732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2163  HhH-GPD family protein  27.36 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338559  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  30.77 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.1 
 
 
236 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4369  AlkA domain protein  30.34 
 
 
300 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  30.53 
 
 
232 aa  46.2  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2923  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  21.46 
 
 
302 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.43 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  36.51 
 
 
225 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  24.14 
 
 
213 aa  44.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2326  alcohol dehydrogenase  25 
 
 
503 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  30.85 
 
 
216 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  28.3 
 
 
226 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3357  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  27.07 
 
 
486 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1888  alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753852  normal  0.559526 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  43.18 
 
 
236 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  30.28 
 
 
233 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24680  DNA-3-methyladenine glycosylase II /DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase /Transcriptional regulator Ada  24.68 
 
 
536 aa  43.5  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  44.68 
 
 
254 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.34 
 
 
230 aa  42.7  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3755  AraC family transcriptional regulator  24.71 
 
 
489 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  26.43 
 
 
287 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2913  alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 
308 aa  42.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.304572 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  29.67 
 
 
232 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  30.38 
 
 
232 aa  42.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10840  hypothetical base excision DNA repair protein (Eurofung)  44.9 
 
 
502 aa  42.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00957228  normal  0.419828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>