99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2577 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  100 
 
 
312 aa  642    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  99.36 
 
 
312 aa  638    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  46.15 
 
 
295 aa  273  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  44.81 
 
 
297 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  42.19 
 
 
295 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  42.39 
 
 
300 aa  238  1e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  40 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  32.18 
 
 
272 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  30.72 
 
 
286 aa  165  9e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30.49 
 
 
285 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  33.67 
 
 
279 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  29.83 
 
 
285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  32.8 
 
 
299 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  30.17 
 
 
283 aa  146  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  31.21 
 
 
287 aa  142  5e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.8 
 
 
307 aa  136  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.16 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  30.89 
 
 
336 aa  121  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.76 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.16 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  27.42 
 
 
299 aa  116  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  24.92 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.55 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.27 
 
 
308 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.99 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.561807 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  29.06 
 
 
414 aa  96.7  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.03 
 
 
313 aa  93.2  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  26.06 
 
 
410 aa  91.7  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  25.32 
 
 
311 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.16 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.71 
 
 
312 aa  86.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  24.29 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  27.94 
 
 
245 aa  75.5  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  26.7 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.01 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  22.59 
 
 
303 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  22.17 
 
 
303 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  22.61 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  21.76 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  29.91 
 
 
300 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  21.76 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  21.76 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  21.76 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0318  HhH-GPD family protein  25.32 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.536275 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  24.67 
 
 
309 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  21.79 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  25.11 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  26.49 
 
 
297 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  21.94 
 
 
303 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0541  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  23.21 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256846  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  22.73 
 
 
287 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0353  HhH-GPD family protein  26.2 
 
 
282 aa  53.1  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0948  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  21.62 
 
 
477 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511809  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0490  endonuclease III domain protein  21.85 
 
 
287 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3357  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  25.2 
 
 
486 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3954  AlkA domain protein  32.67 
 
 
305 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0202431  normal  0.626285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1317  transcriptional regulator Ada  24.5 
 
 
467 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238838  normal  0.620865 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6507  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.72 
 
 
319 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000337261  normal  0.0896284 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3170  alcohol dehydrogenase  28.71 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000626479  decreased coverage  0.000000129498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3087  alcohol dehydrogenase  30.69 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00020691  hitchhiker  0.00000000000128814 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4833  endonuclease III domain protein  21.01 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00136763  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1032  transcriptional regulator, AraC family  27.55 
 
 
513 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2712  transcriptional regulator, AraC family protein  26.4 
 
 
511 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1029  transcriptional regulator, AraC family  27.55 
 
 
513 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2538  AlkA-like  28.71 
 
 
319 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000684088  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3151  alcohol dehydrogenase  28.71 
 
 
319 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000306407  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3037  AlkA domain protein  24.64 
 
 
376 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0138739  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2531  Ada, metal-binding  26 
 
 
545 aa  46.6  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.645313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0541  endonuclease III domain protein  21.49 
 
 
287 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0399  DNA-3-methyladenine glycosylase II (3-methyladenine-DNA glycosidase)  20.59 
 
 
287 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2800  alcohol dehydrogenase  29.7 
 
 
565 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0403  DNA-3-methyladenine glycosylase II  20.59 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  21.05 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2326  alcohol dehydrogenase  23.5 
 
 
503 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0471  endonuclease III domain protein  20.59 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1557  transcriptional regulator, AraC family  29 
 
 
565 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.486878  hitchhiker  0.00513105 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0413  DNA-3-methyladenine glycosylase II, C-terminus  21.5 
 
 
213 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  21.69 
 
 
288 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2940  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 
565 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.91789  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2359  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  25.63 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1829  transcriptional regulator, AraC family  21.83 
 
 
517 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.719428  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.47 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  28.09 
 
 
278 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2497  alcohol dehydrogenase  28 
 
 
563 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0595  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  19.59 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1888  alcohol dehydrogenase  20.35 
 
 
292 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753852  normal  0.559526 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  22.66 
 
 
219 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  23.81 
 
 
201 aa  43.5  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2352  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  25.11 
 
 
289 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2308  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  25.13 
 
 
289 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113008  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2467  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  25.13 
 
 
289 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2252  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  25.13 
 
 
289 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3244  HhH-GPD family protein  22.27 
 
 
198 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2820  alcohol dehydrogenase  28.71 
 
 
565 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  24.07 
 
 
210 aa  42.7  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1638  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II  21.43 
 
 
504 aa  42.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3204  alcohol dehydrogenase  19.34 
 
 
324 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1420  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II  28 
 
 
542 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.484928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>