114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1164 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  100 
 
 
312 aa  653    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  43.27 
 
 
312 aa  291  7e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  46.85 
 
 
287 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  45.67 
 
 
313 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  44.69 
 
 
312 aa  280  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  43.97 
 
 
311 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  42.67 
 
 
312 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  31.49 
 
 
279 aa  124  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  29.59 
 
 
284 aa  122  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  34.16 
 
 
283 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  27.69 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.38 
 
 
285 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.16 
 
 
300 aa  106  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  27.27 
 
 
285 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  28.57 
 
 
336 aa  101  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  29.35 
 
 
312 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  28.99 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  27.81 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.33 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.78 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  25 
 
 
414 aa  90.5  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  24.43 
 
 
293 aa  89.4  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  29.33 
 
 
309 aa  85.9  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  29.47 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  26.92 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.82 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  25.08 
 
 
299 aa  79  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.37 
 
 
308 aa  77  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  27.04 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.74 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  29.91 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  27.98 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  29.47 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  24.46 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.67 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.67 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.67 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  24.67 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.3 
 
 
303 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2923  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.11 
 
 
302 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  32 
 
 
303 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.02 
 
 
303 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.1 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  31.33 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.56 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  28.19 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0318  HhH-GPD family protein  28.37 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.536275 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.01 
 
 
303 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4053  HhH-GPD family protein  31.79 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3087  alcohol dehydrogenase  29.68 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00020691  hitchhiker  0.00000000000128814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2773  transcriptional regulator, AraC family  29.44 
 
 
491 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.71 
 
 
274 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2505  putative transcription regulator protein  26.4 
 
 
490 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0201165 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.51 
 
 
288 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3301  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  27.71 
 
 
494 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0977453  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3170  alcohol dehydrogenase  26.14 
 
 
319 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000626479  decreased coverage  0.000000129498 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  23.59 
 
 
410 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3766  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.2 
 
 
218 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.22 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  27.31 
 
 
207 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.473348 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01974  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  29.86 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6507  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.49 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000337261  normal  0.0896284 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2361  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  29.86 
 
 
285 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3954  AlkA domain protein  29.03 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0202431  normal  0.626285 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3006  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  29.86 
 
 
282 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.538332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01963  hypothetical protein  29.86 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1589  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.86 
 
 
282 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0738  HhH-GPD  26.9 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00497967  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  35.64 
 
 
217 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2209  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  29.86 
 
 
282 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1573  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  29.86 
 
 
282 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0353  HhH-GPD family protein  25.42 
 
 
282 aa  49.7  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0992  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  29.37 
 
 
282 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3399  AraC family transcriptional regulator  24.45 
 
 
491 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0044  Ada metal-binding domain-containing protein  31.14 
 
 
513 aa  49.7  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  43.14 
 
 
269 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2359  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  27.44 
 
 
289 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2538  AlkA-like  25.49 
 
 
319 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000684088  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3151  alcohol dehydrogenase  25.49 
 
 
319 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000306407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.37 
 
 
163 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.05 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.48 
 
 
287 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0739  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.48 
 
 
208 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  36.62 
 
 
278 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1164  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  29.17 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2308  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  26.83 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113008  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  26.09 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3495  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.84 
 
 
220 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482188 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2352  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  26.83 
 
 
289 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2252  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  26.83 
 
 
289 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2467  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  26.83 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0490  endonuclease III domain protein  26.81 
 
 
287 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0541  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  27.54 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256846  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1638  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.41 
 
 
504 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.84 
 
 
251 aa  46.2  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0775  HhH-GPD family protein  25.52 
 
 
309 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7756  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 
564 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0399  DNA-3-methyladenine glycosylase II (3-methyladenine-DNA glycosidase)  25.36 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.48 
 
 
208 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545476  normal  0.965549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0738  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.48 
 
 
207 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>