162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2006 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  100 
 
 
283 aa  588  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  60.07 
 
 
279 aa  353  1e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  43.43 
 
 
285 aa  226  3e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  43.91 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  41.39 
 
 
286 aa  208  8e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  43.61 
 
 
285 aa  203  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  34.81 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  36.1 
 
 
299 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  36.23 
 
 
297 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  33.45 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  34.28 
 
 
306 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  31.73 
 
 
295 aa  152  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  30.17 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  30.17 
 
 
312 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  33.1 
 
 
300 aa  145  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.88 
 
 
293 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  33.61 
 
 
272 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30.63 
 
 
284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  36.7 
 
 
307 aa  135  8e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  29.15 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  34.44 
 
 
308 aa  128  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  30.26 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  34.57 
 
 
309 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  32.53 
 
 
313 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  29.71 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.77 
 
 
334 aa  119  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  34.16 
 
 
312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  31.86 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30.71 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  31.06 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  32.98 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  29.83 
 
 
312 aa  99  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  30.7 
 
 
245 aa  90.1  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  32.04 
 
 
410 aa  87.8  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  24.68 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.74 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.69 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.74 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.74 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.74 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.74 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.59 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0761  endonuclease III  27.52 
 
 
220 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.169913  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.01 
 
 
303 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2923  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.18 
 
 
302 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.59 
 
 
303 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.16 
 
 
303 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.05 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.53 
 
 
230 aa  56.6  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  27.21 
 
 
212 aa  56.2  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0403  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.33 
 
 
287 aa  55.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0471  endonuclease III domain protein  29.33 
 
 
287 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0197  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  28.47 
 
 
213 aa  55.5  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000114708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0413  DNA-3-methyladenine glycosylase II, C-terminus  29.33 
 
 
213 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.59 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.51 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  31.55 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.17 
 
 
222 aa  54.7  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  28.24 
 
 
218 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  54.55 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  28.67 
 
 
287 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  32.75 
 
 
297 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0541  endonuclease III domain protein  29.08 
 
 
287 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  29.86 
 
 
218 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0044  Ada metal-binding domain-containing protein  31.67 
 
 
513 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  52.27 
 
 
278 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  23.35 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  27.27 
 
 
211 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.54 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0541  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  28 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0399  DNA-3-methyladenine glycosylase II (3-methyladenine-DNA glycosidase)  28 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  27.78 
 
 
219 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  40.28 
 
 
224 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4833  endonuclease III domain protein  28.37 
 
 
287 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00136763  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0490  endonuclease III domain protein  28 
 
 
287 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  29.17 
 
 
218 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.15 
 
 
218 aa  50.1  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  28.28 
 
 
215 aa  49.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3301  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  26.75 
 
 
494 aa  49.7  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0977453  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0468  endonuclease III  28.78 
 
 
210 aa  49.3  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  32.61 
 
 
233 aa  48.9  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  25.35 
 
 
217 aa  48.9  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  29.93 
 
 
228 aa  48.9  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.61 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.19 
 
 
204 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  24.62 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06530  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  25.45 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.937537 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1250  hypothetical protein  21.62 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.858422 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1888  alcohol dehydrogenase  26.47 
 
 
292 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753852  normal  0.559526 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31.43 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0318  HhH-GPD family protein  25.73 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.536275 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  31.54 
 
 
219 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11344  Ada regulatory protein alkA  25.75 
 
 
496 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.334528  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2419  AlkA domain protein  25.61 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.839778  hitchhiker  0.00593166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  23.27 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.510793 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.37 
 
 
236 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  24.65 
 
 
216 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  26.24 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  25.79 
 
 
217 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>